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基于混池测序的抗玉米灰斑病QTL定位

文献类型： 中文期刊

作者： 崔凤超 1 ; 王平喜 1 ; 刘小刚 1 ; 邹枨 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 玉米;玉米灰斑病;混池测序;候选基因

期刊名称： 生物技术进展

ISSN： 2095-2341

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 317-323+372

摘要： 玉米灰斑病是由玉米尾孢菌(Cercospora zeine)和玉蜀黍尾孢菌(Cercospora zeae-maydis)引起的真菌性病害,是世界范围内重要的玉米叶部病害之一。以玉米灰斑病抗病自交系Suwan1和感病自交系HM01构建的BC1F1群体为研究材料,在自然发病条件下通过对BC1F1群体中玉米灰斑病的抗性鉴定,选择30株抗病材料和30株感病材料分别构建DNA抗、感混池。在对两个混池进行高通量测序后,通过质量控制和数据分析得到两个极端混池中的变异信息。利用高质量SNP标记对应的两个混池中测序深度差异进行统计检验,成功鉴定了29个玉米灰斑病抗性QTL(quantitative trait loci)。利用Maize GDB网站在29个抗病QTL内共搜索到2 768个基因,通过Phytozome网站与拟南芥和水稻基因组进行同源比对,在1号、5号和10号染色体上分别确定了1个基因作为抗玉米灰斑病的候选基因。

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