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温热带玉米株高的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭子锋 1 ; 徐孝洁 1 ; 刘小刚 1 ; 王山荭 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 玉米;株高;全基因组关联分析

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 31-36

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以365份遗传背景丰富的玉米自交系为材料,采用自主研发的55K芯片,在海南三亚、河南新乡和北京顺义3个环境下对玉米自交系株高进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)。结果表明,株高在3个环境下变异非常丰富,有从低纬度到高纬度逐渐增加的趋势,株高在基因型、环境、基因型与环境互作方面均达极显著差异水平。全基因组关联分析表明,不同环境下均检测到与株高显著关联的位点,在第1、3、5、6、7、8号染色体上均发现了显著关联的SNP。新乡和顺义环境下,在bin5.05区段发现了显著关联的SNP;三亚和顺义环境下,在bin6.05区段发现了显著关联的SNP。对关联分析显著的SNP位点比对到B73参考基因组上,在maizeGDB网站上得到22个最可能的候选基因,为探索玉米株高遗传机制提供参考。

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