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基于元分析的抗玉米灰斑病QTL比较定位

文献类型： 中文期刊

作者： 王平喜 1 ; 简银巧 1 ; 张红伟 1 ; 谢传晓 1 ; 邹枨 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 玉米;灰斑病;“一致性”QTL;元分析;基因比较定位

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2014 年 22 卷 01 期

页码： 56-61+66

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以玉米遗传连锁图谱IBM2 2008 Neighbors为参考图谱,整合65个抗玉米灰斑病QTL,构建QTL综合图谱。采用元分析方法优化65个QTL,获得11个"一致性"QTL区间,分别位于染色体bin区的1.05、1.06、2.03、2.07、3.02、4.05、5.03、5.05、7.02、8.07、9.03位置,其在遗传连锁图谱上对应的位置分别为442.21、528.27、228.10、478.00、74.65、311.59、169.62、302.35、252.19、422.70、257.93 cM。对两个具有较多报道和较高表型贡献的"一致性"QTL区间bin1.05和bin1.06,从MaizeGDB网站搜索得到324个基因。因抗病基因在结构上具有高度保守性,将324个基因分别与水稻和拟南芥基因组进行同源比对,在bin1.05和bin1.06内分别确定了7个和3个基因作为玉米抗灰斑病候选基因。

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