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侵染中国陕西南瓜的中国南瓜曲叶病毒的鉴定和全基因组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 冯润滋 1 ; 杜敏 1 ; 陈诚 1 ; 马子玥 1 ; 周雪平 1 ; 杨秀玲 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害综合治理全国重点实验室

关键词: 中国南瓜曲叶病毒;小RNA深度测序;PCR;基因组序列

期刊名称: 植物保护

ISSN: 0529-1542

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 121-128

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确南瓜叶片上卷、黄化的症状是否由病毒侵染引起,本研究采用小RNA深度测序对采集自陕西地区的南瓜叶片样品进行了鉴定。结果显示,侵染南瓜样品的病毒可能是中国南瓜曲叶病毒(squash leaf curl China virus, SLCCNV)。经PCR扩增并且克隆测序获得了病毒的DNA-A和DNA-B组分的全基因组序列。序列比对发现,所克隆的DNA-A组分与SLCCNV海南分离物(SLCCNV-Hn61)DNA-A的一致性最高,为99.1%;DNA-B组分与SLCCNV-Hn61和三亚分离物SLCCNV-SY的DNA-B组分一致性最高,为96.8%。系统进化树分析发现所克隆的DNA-A和DNA-B组分分别与SLCCNV-Hn61和SLCCNV-SY的亲缘关系最近。以上研究结果表明侵染陕西南瓜叶片的病毒是SLCCNV的分离物。这是首次报道SLCCNV在陕西地区的危害,研究结果为当地经济作物南瓜的病害防控提供参考。

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