文献类型： 中文期刊
作者： 杨菲 1 ; 张明振 1 ; 周雪平 1 ; 李方方 1 ;
作者机构： 1.中国农业科学院植物保护研究所
关键词： 大豆花叶病毒;小RNA深度测序;基因组序列
期刊名称： 植物保护
ISSN： 0529-1542
年卷期： 2024 年 004 期
页码： 39-47
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 本研究利用小RNA深度测序技术在河北卢龙大豆叶片上检测到6株大豆花叶病毒(soybean mosaic virus, SMV),命名为SMV-Gm1～SMV-Gm6。根据小RNA深度测序结果和参考基因组序列设计引物克隆了SMV河北分离物的基因组序列。测序结果经拼接后获得了6个SMV基因组全长序列，大小分别为9 588 nt(SMV-Gm1、SMV-Gm3和SMV-Gm5)和9 584 nt(SMV-Gm2、SMV-Gm4和SMV-Gm6)。开放阅读框位于基因组第132位至第9 332位核苷酸，编码一个多聚蛋白(分子量约为350 kD)。BLAST比对和系统发育分析发现，SMV-Gm1、SMV-Gm3和SMV-Gm5与江苏SMV分离物(登录号：MH919386)的基因组核苷酸序列相似性最高，为98.06%～98.07%,且遗传距离较近，并与江苏、浙江和山西SMV分离物聚为一小簇；SMV-Gm2、SMV-Gm4和SMV-Gm6与韩国SMV分离物(登录号：FJ640954)的基因组核苷酸序列相似性最高，为98.48%～98.51%,且遗传距离较近。
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