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基于EST-SSR标记的云南大茶树遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周萌 1 ; 李友勇 1 ; 孙雪梅 1 ; 王家金 1 ; 谢瑾 1 ; 成浩 2 ; 汪云刚 1 ; 刘本英 1 ;

作者机构: 1.云南省农科院

2.中国农业科学院

关键词: 茶树;EST-SSR;遗传多样性;亲缘关系

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2013 年 28 卷 S1 期

页码: 96-101

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用EST-SSR标记技术对云南省不同区域采集的39份古茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系研究。结果表明:43对EST-SSR引物共扩增出121条多态性谱带,有效等位基因变异占比重的73.88%。多态性信息量PIC值为0.05~0.74,平均为0.469。基因多样性指数平均值为0.53,Shannon指数平均值为0.81,均高于0.5。遗传相似系数0.41~0.91,平均值为0.65,显示云南大茶树的遗传基础相对比较宽,具有较高的遗传多样性水平。SSR聚类分析表明,大茶树的遗传距离和亲缘关系与地理分布有一定的关系,在分子水平上显示了部分云南大茶树的亲缘关系,有助于今后野生大茶树的保护及利用研究。

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