文献类型： 中文期刊

作者： 王艳玲 ¹ ; 许彦宾 ² ; 李琼 ² ; 王盼乔 ² ; 胡建斌 ² ; 杨路明 ² ; 朱华玉 ² ; 孙守如 ² ; 马长生 ³ ;

作者机构： 1.河南农业大学园艺学院/河南省果树瓜类生物学重点实验室

2.;河南农业大学园艺学院/河南省果树瓜类生物学重点实验室

3.;河南农业大学园艺学院/河南省果树瓜类生物学重点实验室;

关键词： 甜瓜;核心种质;果实性状;全基因组关联分析(GWAS)

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2017 年 09 期

页码： 1434-1442

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 甜瓜(Cucumis melo)果实外观性状是重要的农艺性状,发掘影响甜瓜果实性状变异的基因(位点)是对果实外观品质进行遗传改良的基础。为此,本研究利用在甜瓜染色体上均匀分布的104个SSR,对甜瓜核心种质进行基因型鉴定,并对2013~2015年连续3年间的5个果实性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)。结果表明,在甜瓜核心种质中共检测到456个等位基因,标记的多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.12~0.89,平均PIC为0.51。核心种质的遗传多样性较丰富,5个果实性状的多样性指数(Shannon Wiener index,H′)均高于2.0。基于贝叶斯模型可将核心种质分为2个亚群,亚群的划分与甜瓜亚种分类一致。利用GWAS在3个环境下共检测到42个极显著关联位点(P<0.01),4个位点(HNM36、DM0035、HNM38和DM0767)在3年间重复出现,21个位点在2年间重复出现,一些稳定表达的位点与前人连锁分析结果的一致性较高。与果纵径(fruit length,FL)、果横径(fruit diameter,FD)、果形指数(fruit shape index,FS)、果肉厚度(flesh thickness,FT)和单果鲜重(fruit fresh weight,FW)相关位点数分别有10、5、9、8和10个,具有最大表型解释率的位点分别为HNM36、HNM16、CMCCA145、HNM31和HNM31。研究结果为甜瓜果实性状QTL精细定位、候选基因发掘和分子标记开发提供基础。