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大蒜全基因组NCED基因鉴定与功能初探

文献类型： 中文期刊

作者： 袁晓戈 1 ; 李富 1 ; 张雪钰 1 ; 曾铮 1 ; 何巧芸 1 ; 周智满 1 ; 王延周 1 ; 杨喜爱 1 ; 刘头明 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院麻类研究所

关键词： 大蒜;NCED基因;差异表达;基因功能

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 47-56

收录情况： 北大核心

摘要： 采用生物信息学方法,从大蒜基因组中共鉴定出AsaNCED基因14个,预测其氨基酸数量为409~599个,蛋白分子量为46421.95~67090.27 Da,理论等电点为5.48~6.87.多数基因外显子数为1个,少数为11~12个.在启动子顺式作用元件中,光、脱落酸和茉莉酸甲酯响应元件在数量上占据优势,并广泛分布在不同的基因家族成员中;同时也存在与干旱相关的MYB结合位点、防御与胁迫响应元件、伤口响应元件和种子特异性调控元件.该基因家族成员在不同组织中具有一定的表达差异性.通过异源过表达AsaNCED4获得转基因拟南芥,其株高明显低于野生型,qRT-PCR分析发现AsaNCED4基因受盐胁迫诱导上调表达.

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