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鸭坦布苏病毒分离鉴定及全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王宾宾 1 ; 闫大为 1 ; 倪欣涛 1 ; 李雪松 1 ; 滕巧泱 1 ; 杨健美 1 ; 陈鸿军 1 ; 刘芹防 1 ; 李泽君 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院上海兽医研究所

关键词： 鸭坦布苏病毒;分离鉴定;全基因组序列测定;进化树

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 8-14

收录情况： 北大核心

摘要： 本文采集2015年浙江省2个鸭养殖场中疑似鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)感染的雌麻鸭卵巢病料,经组织研磨处理,DF-1细胞纯化,成功分离了2株鸭坦布苏病毒(DTMUV),分别命名为ZJ201501和ZJ201504。利用9对两两相互重叠的PCR引物,对这2株病毒的全基因进行分段PCR扩增,经序列测定和拼接,得到病毒的全基因组序列。核苷酸序列和E蛋白氨基酸序列比对分析发现:ZJ201501和ZJ201504的核苷酸同源性高达99.9%,全长氨基酸仅有2个位点差异;与选取的19株DTMUV参考序列相比,在核苷酸水平和E蛋白氨基酸水平上,其同源性分别大于97.1%和98.4%,而ZJ201501和ZJ201504与早期分离的DTMUV FX2010遗传距离最远,这表明DTMUV在鸭群中发生了一定的变异。本研究为进一步了解DTMUV的遗传进化提供了理论依据。

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