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油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析

文献类型: 中文期刊

作者: 左蓉 1 ; 吴姗 1 ; 刘杰 1 ; 胡鸣 1 ; 程晓晖 1 ; 刘越英 1 ; 白泽涛 1 ; 刘胜毅 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院油料作物研究所

关键词: 甘蓝型油菜;F-box-LRR基因家族;菌核病;基因表达

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2022 年 44 卷 003 期

页码: 503-514

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 由核盘菌引起的菌核病是一种重要的真菌性病害,筛选菌核病抗病基因对抗病育种具有重要意义.F-box基因多参与植物抗逆反应,LRR作为抗病基因的重要结构域,在植物抗病防卫中起着重要的作用.本研究通过生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中对F-box-LRR基因进行了全基因组鉴定,基于已发表的中双11组织表达数据以及油菜不同品种中油821(抗病)和Westar(感病)接种核盘菌前后的转录组数据,对可能响应核盘菌诱导的BnF-box-LRR基因进行筛选,并结合荧光定量PCR进行验证.共鉴定到161个BnF-box-LRR基因,从系统进化树上可分为4个亚类(FBXLRR1,FBXLRR2,FBXLRR3和FBXLRR4),其中第四亚类FBXLRR4在蛋白保守序列分布以及基因结构方面,与其它三个亚类具有较大差异,且与拟南芥参与植物抗逆的同源基因聚为一类,因此推测该分支可能主要参与植物胁迫响应.表达分析表明FBXLRR4家族基因在根和叶中有较高的表达水平,且在核盘菌诱导后具有明显的表达变化,暗示这些基因可能参与油菜菌核病抗性功能.

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