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美国短毛黑水貂快速生长过程中转录组差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 荣敏 1 ; 张然然 1 ; 涂剑峰 1 ; 王天娇 1 ; 孙丽敏 1 ; 杨颖 1 ; 徐佳萍 1 ; 邢秀梅 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院特产研究所特种经济动物分子生物学重点实验室

关键词： 水貂;肌肉;生长;转录组

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2019 年 009 期

页码： 1787-1801

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在对美国短毛黑水貂快速生长过程中转录组差异表达进行分析.本试验将美国短毛黑水貂45、90日龄各3只健康公貂的胸肌组织作为试验材料,利用Illumina HiSeqTM2500高通量测序平台建立转录组文库,对两个生长阶段差异显著性的基因进行GO功能富集和KEGG Pathway分析,寻找调控水貂快速生长期的相关候选基因和代谢通路,并利用qRT-PCR对转录组测序结果进行验证.结果表明,以P<0.05,|log2FC|>1为条件筛选到279个显著差异基因,对这些差异基因进行GO和KEGG分析,筛选到与肌肉生长相关显著富集GO条目有66条、相关差异表达基因44个,其中上调20个,下调24个;与肌肉生长相关显著富集KEGG通路12条,如p53信号通路、PPAR信号通路、FOXO信号通路等.这些差异基因可能在水貂的快速生长过程中起到调控作用,可以作为后续研究水貂生长发育的候选基因.本研究结果为探究水貂生长发育调控机制及培育大体型水貂品种奠定基础.

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