文献类型： 中文期刊
作者： 李火明 1 ; 夏颖 1 ; 李干武 1 ; 蔡文通 1 ;
作者机构： 1.兽医生物技术国家重点实验室
关键词： 尿路致病性大肠杆菌;DNA甲基化转移酶;单分子实时测序;限制-修饰系统
期刊名称： 微生物学报
ISSN： 0001-6209
年卷期： 2021 年 008 期
页码： 2457-2468
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】多方面鉴定尿路致病性大肠杆菌中的Ⅰ型限制-修饰（restriction-modification,RM）系统C5423-5425,并揭示其功能与生理意义。【方法】利用Lambda Red重组系统构建CFT073 DNA甲基化转移酶基因缺失株Δc5424;利用单分子实时测序分析以获得C5424甲基化修饰的位点与基序;利用转化效率试验说明RM系统抵御外源DNA的转化;利用转录组测序和荧光定量RT-PCR鉴定C5424的调控基因;利用软琼脂平板运动试验等方法研究细菌生理功能的变化。【结果】用生物信息学方法鉴定了一个Ⅰ型RM系统;获得了c5424的突变株;鉴定了C5424修饰的靶序列GmAGNNNNNNNGTCA/TGmAC NNNNNNNCTC,并揭示了靶序列在基因组中的分布;C5424系统可以抵御外源DNA的进入;c5424的缺失显著影响17个基因的表达,包括运动相关基因motB和抗活性氯基因rclR等;c5424的缺失显著影响CFT073的运动能力和抗次氯酸的能力。【结论】本文从多方面鉴定了尿路致病性大肠杆菌CFT073中的I型RM系统C5423-5425,这个系统对细菌具有重要的生理意义。本文对研究细菌的表观遗传学具有参考价值。
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