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基于全基因组关联分析筛选山桐子性别分子标记

文献类型： 中文期刊

作者： 左毅 1 ; 刘红兵 1 ; 杨志刚 1 ; 李彬 1 ; 向浩鑫 1 ; 朱纯真 1 ; 王雷 1 ;

作者机构： 1.中国科学院植物研究所,植物分子生理学重点实验室;国家植物园;中国农业科学院农业基因组研究所,岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心,农业农村部农业基因数据分析重点实验室;内蒙古自治区农牧业科学院,蔬菜花卉研究所;中国科学院大学;国家盐碱地综合利用技术创新中心

关键词： 山桐子;性别决定;分子标记

期刊名称： 植物学报

ISSN： 1674-3466

年卷期： 2024 年 03 期

页码： 414-421

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 山桐子(Idesia polycarpa)是我国特有且极具开发潜力的油料树种,果实含油率高且油品好。在苗期通过分子生物学手段对山桐子进行性别鉴定,可有效降低种苗培养成本。在前期组装的染色体级别高质量山桐子基因组基础上,进一步对山桐子雌雄群体进行全基因组重测序,根据雌雄株系的特异性片段,确定山桐子属于ZW/ZZ性别决定类型;并根据3.365×107个SNPs,结合性别表型进行全基因组关联分析,找到控制性别的19号染色体,并将性别决定区段定位到35Mb附近;针对显著性位点,开发了性别共显性CAPS分子标记。该方法可在幼苗期快速、高效鉴定山桐子的性别,极大地降低了山桐子育苗环节的生产成本,也可在山桐子种质鉴定及分子标记辅助育种等方面为产业提供技术支撑。

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