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江苏省部分地区畜禽源弯曲菌耐药基因、毒力基因及遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 唐梦君 1 ; 周倩 1 ; 张小燕 1 ; 唐修君 1 ; 陆俊贤 1 ; 陈薇 1 ; 高玉时 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院家禽研究所

关键词: 弯曲菌;全基因组测序;多重耐药;耐药基因;毒力基因

期刊名称: 微生物学通报

ISSN: 0253-2654

年卷期: 2025 年 52 卷 004 期

页码: 1710-1723

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【背景】弯曲菌(Campylobacter)是引起食源性疾病的主要病原菌之一,家禽和猪是其常见和重要宿主,畜禽在屠宰加工过程中易污染胴体导致人类感染,对食品安全和公共健康造成巨大威胁。【目的】通过应用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)分析52株畜禽来源弯曲菌的耐药基因、毒力基因及遗传多样性。【方法】采用琼脂稀释法对其最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration, MIC)进行测定,通过二代测序平台进行全基因组测序,应用基因组流行病学数据平台ResFinder数据库分析其耐药基因,通过毒力因子数据库(virulence factor database, VFDB)筛选毒力基因,应用PubMLST数据库分析菌株序列型(sequencetype,ST)和克隆复合体(clonalcomplex,CC)。【结果】52株弯曲菌对环丙沙星、四环素、萘啶酸耐药明显,对氟苯尼考敏感,多重耐药率为57.69%。WGS分析发现52株弯曲菌共有6大类16种获得性耐药基因及与喹诺酮类耐药相关的gryA基因点突变和与大环内酯类耐药相关的23SrRNA点突变。除检出常见的氨基糖苷类、β-内酰胺类、四环素类(tetO)耐药基因外,还发现ermB、ermA、fexA、optrA、tetL和lnuC等在弯曲菌新流行的耐药基因;52株弯曲菌携带120种毒力相关基因,其中细菌黏附、荚膜合成、侵袭、鞭毛及趋化蛋白等相关基因携带率较高,空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)携带毒力基因的数量普遍多于结肠弯曲菌(Campylobacter coli);多位点序列分析(multilocus sequencing typing, MLST)结果显示共得到28个ST型和14个CCs (包括4个已知的CCs和10个未知CCs,以CC-828克隆复合体为主),分离株之间具有较高的遗传多样性。【结论】江苏畜禽源弯曲菌多重耐药现象严重,耐药基因复杂多样,毒力基因分布广泛,以克隆复合体CC-828为主,具有较高的遗传多样性。该研究结果为我国动物源性弯曲菌耐药性监测提供了基础数据。

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