您好,欢迎访问黑龙江省农业科学院 机构知识库!

基于转录组学分析性别、月龄对荷斯坦牛网膜脂肪组织炎症相关基因表达的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 柴金宝 1 ; 刘利 1 ; 王芳 1 ; 杨硕 1 ; 曹培丽 1 ; 赵晓川 1 ; 许珊珊 1 ; 孟详人 1 ; 卜也 1 ; 岳萌萌 1 ; 武瑞 2 ; 孙芳 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室

2.黑龙江八一农垦大学动物科技学院

关键词: 荷斯坦牛;转录组;性别;月龄;脂肪组织炎症

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2023 年 31 卷 005 期

页码: 901-913

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 公牛(Bos taurus)去势和长期育肥能够促进内脏脂肪的沉积,过多的脂肪沉积易引发机体慢性炎症,然而有关牛网膜脂肪组织炎症的分子机理研究相对较少.本研究以牛网膜脂肪组织为研究对象,旨在探究性别和月龄对荷斯坦育肥牛网膜脂肪组织炎症相关基因表达的影响.选择16月龄荷斯坦公牛(BF16)、阉牛(SF16)及26月龄阉牛(SF26)各3头,测定生长和血液生化指标,屠宰后采集网膜脂肪组织,进行组织切片苏木精-伊红染色(hematoxylin-eosin staining,HE)染色,采用RNA-seq技术对3组牛网膜脂肪组织进行转录组学分析,筛选组间差异基因,并对差异基因进行GO功能注释和KEGG富集分析、qPCR验证、候选基因筛选及蛋白网络互作分析.结果显示,共得到1173个组间差异表达基因,富集在8个基因表达趋势模式中;功能分析显示差异基因富集多个与炎症相关的生物学过程和信号通路;随机选择6个差异表达的基因进行qPCR验证,表达趋势与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠;筛选到与炎症相关的5个生物学过程条目和5个信号通路共50个非冗余基因,聚类分析发现,与BF16组相比,去势能够上调SF16组网膜脂肪组织中抗炎症和促脂肪细胞分化基因(如TNF-α诱导蛋白3(TNF alpha induced protein 3,TNFAIP3),骨形成蛋白2(bone morphogenetic protein 2,BMP2)等)的表达,下调促炎症基因(如白细胞介素1β(interleukin-1beta,IL1B))的表达;与BF16和SF16组相比,长期育肥能够上调SF26组网膜脂肪组织中衰老和慢性炎症相关的基因(如半乳糖凝集素3(galectin 3,LGALS3),C-C基序趋化因子受体7(C-C motif chemokine receptor 7,CCR7)等)的表达.蛋白网络互作分析显示IL1B为关键中心节点.本研究结果为优化利用荷斯坦阉牛生产大理石纹牛肉技术提供理论依据.

  • 相关文献

[1]β-酪蛋白A2A2基因型奶牛在黑龙江省某牛场中的分布及泌乳性能. 李红宇,黄萌,邵广,赵文江,刘文,郭春晖,王德香,阿晓辉,王树茂,姜兴刚,贾斌. 2023

[2]传统中草药高通量测序技术RNA-seq及lncRNA挖掘的应用策略. 白晶,李力恒,孙尧,扈韵绮,付博. 2014

[3]高通量测序技术及其在农业科学研究中的应用. 闫绍鹏,杨瑞华,冷淑娇,王秋玉,周容涛. 2012

[4]大丽轮枝孢(Verticillium dahliae)Asp f2类蛋白(VDAL)在水稻(Oryza sativa)中抵御真菌病害及提高产量的功能分析. 王艳君,付玉华,钟英丽,李洪亮,任海洋,董国军,任佐华,王凯,高媛辉,巩志忠,袁晓辉,齐俊生. 2020

[5]南瓜干旱胁迫相关基因的转录组分析. 赵茜. 2020

[6]水稻分蘖期氮素应答的转录组动态分析. 刘天奇,高红秀,谢威,张雪晴,陈娜娜,梅雪锋,邢佳妮,徐振华,张忠臣. 2021

[7]亚麻响应低钾胁迫转录谱分析. 黄文功,姜卫东,姚玉波,宋喜霞,刘岩,陈思,赵东升,吴广文,袁红梅,任传英,孙中义,吴建忠,康庆华. 2021

[8]微生物组-转录组联合分析肠道菌群对SPF鸡的调节作用. 尹海畅,万德财,王含琼,姚婉岐,李忠秋,刘娣. 2023

作者其他论文 更多>>