文献类型: 中文期刊
作者: 赵青 1 ; 都真真 1 ; 李锡香 1 ; 宋江萍 1 ; 张晓辉 1 ; 阳文龙 1 ; 贾会霞 1 ; 王海平 1 ;
作者机构: 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业农村部园艺作物生物学与种质创制重点实验室
关键词: 大蒜;SSRseq;群体结构;遗传多样性
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2021 年 007 期
页码: 1397-1408
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用筛选出的24对SSRseq引物对来自世界各地的676份大蒜种质进行遗传多样性、主坐标和群体遗传结构分析。结果表明:24对SSRseq标记在676份种质中共检测到124个多态性位点,平均等位位点数为5.17个,Nei’s多样性指数平均为1.77,Shannon’s信息指数平均为0.62,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.33和0.34。用邻近法将676份资源划分为4类,其中第Ⅰ类包括以来源于亚洲中高纬度为主的186份种质,第Ⅱ类包括以来源于欧洲、中亚和北美洲为主的205份种质,第Ⅲ类包括以亚洲半抽薹类型的资源为主的132份种质,第Ⅳ类包括以来源于亚洲低纬度为主的153份种质。主坐标分析表明,亚洲低纬度地区的种质聚集在第Ⅰ类与第Ⅲ类,亚洲中高纬地区、欧洲、北美洲地区的种质聚集在第Ⅱ类。群体遗传结构分析将种质资源划分为4类,与邻近法聚类分析相似,以来自欧洲、中亚、北美洲为主的种质资源群体基因多样性和Shannon’s多样性信息指数最大,分别为0.3213与0.5933。用邻近法聚类分析与群体遗传结构分析均将382份中国资源划分为4类,分别以华北、华南、蒙新、西南地区种质为主。主坐标分析表明,中国华北、华南地区的种质分布在PC1的两端,表现出较远的亲缘关系。研究结果将为后期大蒜资源的深入评价和品种选育提供重要参考。
- 相关文献
[1]甘蓝型油菜2009-2010年候选品种遗传多样性及群体结构. 许鲲,谷铁城,刘凤兰,李浩,陈碧云,高桂珍,伍晓明. 2012
[2]中国南方154份梨地方品种基于SSR标记的遗传多样性与群体结构分析. 齐丹,曹玉芬,胡红菊,张小双,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,徐家玉,刘超,詹俊宇,张思梦. 2023
[3]基于nSSR和cpDNA序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究. 刘振,成杨,杨培迪,赵洋,宁静,杨阳. 2020
[4]95份甘蔗栽培材料的SSR引物筛选及遗传多样性分析. 许雯雯,龙松华,邱财生,郭媛,王慧,郝冬梅,王玉富. 2018
[5]基于SSR标记的黍稷种质资源遗传多样性及亲缘关系研究. 薛延桃,陆平,乔治军,刘敏轩,王瑞云. 2018
[6]基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构. 刘志斋,吴迅,刘海利,李永祥,李清超,王凤格,石云素,宋燕春,宋伟彬,赵久然,赖锦盛,黎裕,王天宇. 2012
[7]与甘蓝中心柱长相关联的EST-SSR标记分析. 孙朋朋,刘基生,张扬勇,方智远,刘玉梅,杨丽梅,龚义勤,柳李旺,李占省. 2014
[8]基于SSR标记的中美紫花苜蓿品种遗传多样性研究. 强海平,余国辉,刘海泉,高洪文,刘贵波,赵海明,王赞. 2014
[9]甘薯引进种SSR遗传多样性分析. 王娇,霍恺森,赵路宽,赵冬兰,唐君,陈艳丽,曹清河. 2018
[10]小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR 分析. 白鹏,程须珍,王丽侠,王素华,陈红霖. 2014
[11]基于SSR分子标记的154份桃品种遗传多样性分析. 殷纪伟,韩贝贝,马莹雪,武星廷,徐振江,姜建福,陈昌文,韩瑞玺. 2023
[12]芝麻资源群体结构及含油量关联分析. 危文亮,张艳欣,吕海霞,王林海,黎冬华,张秀荣. 2012
[13]小扁豆种质资源SSR标记遗传多样性及群体结构分析. 刘金,关建平,徐东旭,张晓艳,顾竟,宗绪晓. 2008
[14]川、渝地方茶树品种的遗传多样性和群体结构. 姚明哲,马春雷,金基强,马建强,陈亮. 2012
[15]老芒麦遗传多样性分析及核心种质构建. 闫伟红,马玉宝,张晶然,王凯,孟庆伟. 2016
[16]中国和国际豌豆核心种质群体结构与遗传多样性差异分析. 宗绪晓,关建平,顾竟,王海飞,马钰. 2009
[17]基于SSR标记的海南54份榴莲种质资源遗传多样性和群体结构分析. 邓会栋,乔阳,郭利军,华敏,谢圣华,冀晓昊,吴晓慧,冯学杰,王海波. 2023
[18]西藏牦牛群体遗传多样性及遗传结构分析. 余道宁,王佟,马晓明,张德荣,欧杰次仁,洛桑顿珠,梁春年. 2024
[19]中国栽培大豆(Glycinemax(L.)Merr.)微核心种质的群体结构与遗传多样性. 宋喜娥,李英慧,常汝镇,郭平毅,邱丽娟. 2010
[20]基于SSR 标记的中美紫花苜蓿品种遗传多样性研究. 强海平,余国辉,刘海泉,高洪文,刘贵波,赵海明,王赞. 2014
作者其他论文 更多>>
-
基于SSR和SRAP标记的沙芥属种质资源遗传多样性分析
作者:门岩;杨忠仁;黄修梅;张晓辉;张凤兰;郝丽珍
关键词:沙芥属;遗传多样性;亲缘关系;SSR标记;SRAP标记
-
芥菜MAPK基因家族成员鉴定及其响应根肿菌侵染的表达分析
作者:徐楚;王海平;宋江萍;张晓辉;贾会霞;韩嘉琪;李芝洁;李森;阳文龙
关键词:芥菜;丝裂原活化蛋白激酶;根肿病;表达分析
-
独头蒜种质资源评价筛选及鳞茎生长发育研究
作者:宋哲;张婷婷;宋江萍;贾会霞;张晓辉;阳文龙;王海平
关键词:独头蒜;种质资源;生长规律
-
基于SRAP分子标记的沙芥居群遗传多样性分析
作者:门岩;杨忠仁;黄修梅;张晓辉;郝丽珍;张凤兰
关键词:沙芥;遗传多样性;亲缘关系;SRAP标记
-
基于SSR标记的百合资源遗传背景分析
作者:韩嘉琪;王海平;宋江萍;贾会霞;张晓辉;李森;徐楚;李芝洁;阳文龙
关键词:百合;种质资源;遗传背景;简单序列重复(SSR)
-
高温胁迫对沙芥与斧翅沙芥幼苗生长和叶绿素荧光动力参数的影响
作者:张韶华;张晓辉;杨忠仁;黄修梅;张凤兰;宁可真
关键词:沙芥;斧翅沙芥;高温胁迫;光合作用;叶绿素荧光动力参数
-
蔬菜等重要经济作物珍稀濒危种质资源现状及保护策略
作者:王海平;宋江萍;张晓辉;阳文龙;贾会霞;王洋
关键词:蔬菜;珍稀濒危种质资源;经济作物




