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利用SSRseq分子标记的大蒜种质资源遗传多样性研究

文献类型: 中文期刊

作者: 赵青 1 ; 都真真 1 ; 李锡香 1 ; 宋江萍 1 ; 张晓辉 1 ; 阳文龙 1 ; 贾会霞 1 ; 王海平 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业农村部园艺作物生物学与种质创制重点实验室

关键词: 大蒜;SSRseq;群体结构;遗传多样性

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2021 年 007 期

页码: 1397-1408

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用筛选出的24对SSRseq引物对来自世界各地的676份大蒜种质进行遗传多样性、主坐标和群体遗传结构分析。结果表明:24对SSRseq标记在676份种质中共检测到124个多态性位点,平均等位位点数为5.17个,Nei’s多样性指数平均为1.77,Shannon’s信息指数平均为0.62,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.33和0.34。用邻近法将676份资源划分为4类,其中第Ⅰ类包括以来源于亚洲中高纬度为主的186份种质,第Ⅱ类包括以来源于欧洲、中亚和北美洲为主的205份种质,第Ⅲ类包括以亚洲半抽薹类型的资源为主的132份种质,第Ⅳ类包括以来源于亚洲低纬度为主的153份种质。主坐标分析表明,亚洲低纬度地区的种质聚集在第Ⅰ类与第Ⅲ类,亚洲中高纬地区、欧洲、北美洲地区的种质聚集在第Ⅱ类。群体遗传结构分析将种质资源划分为4类,与邻近法聚类分析相似,以来自欧洲、中亚、北美洲为主的种质资源群体基因多样性和Shannon’s多样性信息指数最大,分别为0.3213与0.5933。用邻近法聚类分析与群体遗传结构分析均将382份中国资源划分为4类,分别以华北、华南、蒙新、西南地区种质为主。主坐标分析表明,中国华北、华南地区的种质分布在PC1的两端,表现出较远的亲缘关系。研究结果将为后期大蒜资源的深入评价和品种选育提供重要参考。

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