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水牛MFSD2A基因CDS序列克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 梁莎莎 1 ; 于农淇 1 ; 鄢胜飞 1 ; 黄荣春 1 ; 潘伟军 1 ; 李厅厅 1 ; 卢瑛 1 ; 黄健 1 ; 谭正准 1 ; 覃广胜 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区水牛研究所

关键词: 水牛;主要促进因子超家族成员2a(MFSD2A);基因克隆;生物信息学

期刊名称: 中国牛业科学

ISSN: 1001-9111

年卷期: 2025 年 51 卷 003 期

页码: 11-19

摘要: 运用生物信息学方法,对水牛主要促进因子超家族成员2a(major facilitator superfamily domain containing 2a,MFSD2A)基因编码序列进行克隆及分析。以水牛MFSD2A预测基因序列(GenBank登录号:XM_006061915.4)为模板,克隆了水牛MFSD2A基因完整CDS序列,全长1 572 bp,可编码523个氨基酸残基;分子式为C2 669H4 150N652O725S23,分子质量57.71 ku,半衰期30 h,消光系数71 445,脂肪系数105.56,理论等电点(PI)8.2,不稳定系数为34.78,总平均亲水性为0.462,说明水牛MFSD2A属于碱性稳定疏水蛋白质;二级和三级结构分析结果显示,水牛MFSD2A蛋白主要由α-螺旋、β-折叠、衍生片段和无规则卷曲组成,其中α-螺旋占46.65%,β-折叠占4.59%,衍生片段占16.25%,无规则卷曲占32.5%;亚细胞定位结果显示,水牛MFSD2A定位于细胞质膜、内质网、细胞核和线粒体的比例分别为60.9%、30.4%、4.3%和4.4%,说明水牛MFSD2A主要分布于细胞质膜中;跨膜结构和信号肽预测分析表明,该蛋白存在10个跨膜域,不存在信号肽,故此蛋白属于跨膜蛋白,不属于分泌蛋白;磷酸化位点预测结果显示,水牛MFSD2A蛋白共有48个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点22个,苏氨酸磷酸化位点21个,酪氨酸磷酸化位点5个;糖基化位点预测结果显示,水牛MFSD2A蛋白存在1个潜在的N-糖基化位点和77个O-糖基化位点;同源性分析结果表明,水牛MFSD2A的氨基酸序列与黄牛、山羊、猪、骆驼、家犬和人的同源相似性分别为98.7%、98.5%、94.0%、93.5%、91.0%和87.0%,说明MFSD2A具有较高的保守性。

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