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甜菜SSR扩增产物不同检测方法的比较研究

文献类型： 中文期刊

作者： 邹奕 1 ; 刘乃新 1 ; 马龙彪 1 ; 吴则东 1 ; 李红侠 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学;中国农业科学院甜菜研究所/黑龙江大学农作物研究院;中国农业科学院北方糖料作物资源与利用重点开放实验室

关键词： 甜菜;SSR;琼脂糖凝胶电泳;非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳;指纹图谱

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2018 年 35 期

页码： 44-47

摘要： 利用16对甜菜SSR引物对12个不同的甜菜品种进行扩增,分别采用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、3%的Metaphor琼脂糖电泳以及3%的普通琼脂糖电泳对SSR扩增产物进行检测,比较不同检测结果的差异性。结果表明:8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶分辨细小条带的差异远高于3%的Metaphor琼脂糖和普通琼脂糖,而Metaphor琼脂糖的分辨率高于普通琼脂糖;但对于条带较少的引物,3种凝胶未显现出差异;对于条带数较多的引物,如果条带比较集中,3种检测方法差异显著,如果条带比较分散,3种凝胶之间的差异较小。由于Metaphor琼脂糖价格偏高、胶软不易操作且分辨率低于聚丙烯酰胺凝胶,因此不建议使用。而8%的聚丙烯酰胺凝胶则适合于指纹图谱的构建以及遗传多样性分析等,普通琼脂糖可以应用在品种纯度的鉴定。

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