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甜菜铵转运蛋白BvAMT1-3基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 魏多 1 ; 刘铭曦 1 ; 高卓 1 ; 李佳佳 1 ; 刘大丽 1 ; 马龙彪 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学现代农业与生态环境学院;中国农业科学院北方糖料作物资源与利用重点实验室/中国农业科学院甜菜研究所;哈尔滨师范大学生命科学与技术学院;黑龙江大学生命科学学院

关键词: 甜菜;铵转运蛋白;基因;克隆;生物信息学

期刊名称: 中国糖料

ISSN: 1007-2624

年卷期: 2021 年 004 期

页码: 1-8

摘要: 在植物体内,由铵转运蛋白(Ammonium transporters, AMTs)介导植株对铵态氮的吸收和转运。氮素在甜菜糖代谢的过程中起着重要作用,对甜菜AMTs蛋白的功能特性及调控机制进行生物信息学分析对于解析甜菜AMT基因家族的分子功能具有重要意义。本研究通过RT-PCR的方法,在甜菜体内克隆获得了Beta vulgaris ammonium transporter 1-3(BvAMT1-3)基因的全长序列。生物信息学分析结果显示该基因大小为1 388 bp,编码462个氨基酸,分子量约为49.729 kDa,亚细胞定位分析其位于内质网膜结构上的可能性较大。系统进化分析显示5个甜菜AMT蛋白序列可分成2个亚族,AMT3亚族仅有1个成员,其余为AMT1亚族成员,同时甜菜BvAMT1-3蛋白与菠菜SoAMT1-3蛋白的亲缘关系最近。5个AMT基因家族成员均由α-螺旋、β-折叠、扩展链以及无规则卷曲4种形式组成。BvAMTs基因家族间的等电点、亲水性、相对分子质量等理化性质存在差异。此外,BvAMT1-3基因的启动子区检测到与植物逆境胁迫、光反应和生长发育相关的顺式作用元件。研究结果可为后续甜菜BvAMT1-3基因在氮胁迫逆境下分子机制的研究提供一定的科学依据。

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