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水牛ALK5基因克隆分析与组织表达模式研究

文献类型: 中文期刊

作者: 朱鹏 1 ; 赵鲜红 2 ; 粟小平 2 ; 苏节 2 ; 刘金凤 2 ; 刘庆友 2 ; 石德顺 2 ;

作者机构: 1.广西大学亚热带生物资源保护利用国家重点实验室

2.广西大学亚热带生物资源保护利用国家重点实验室;中国农业科学院广西水牛研究所;广西医科大学医学科学实验中心;广西兽医研究所

关键词: 水牛;ALK5基因;克隆分析;表达规律;卵泡发生

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2015 年 07 期

页码: 9-13+246

收录情况: 北大核心

摘要: 为了阐明水牛ALK5基因在水牛卵泡发生过程中的作用,了解其在水牛不同组织中的表达模式,试验采用了RT-PCR及QRT-PCR方法对ALK5基因进行了研究,参考已公布的Gen Bank中牛ALK5基因序列,设计特异性引物应用RT-PCR方法扩增克隆获得目的基因片段;应用生物信息学方法,系统分析和预测了水牛ALK5基因的遗传进化、蛋白质的理化性质、二级和三级结构,并应用QRT-PCR技术对ALK5基因在水牛组织的表达进行了差异分析。结果表明:水牛ALK5基因的编码区全长为1 512 bp,共编码503个氨基酸;水牛ALK5核苷酸序列与牛、绵羊、猪、人和小鼠相应序列的相似性分别为99%、97%、95%、93%和90%,结合系统进化树分析结果推测ALK5基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性;该蛋白呈弱碱性,有信号肽,细胞亚定位于胞膜上,存在low complexity和GS结构,呈典型跨膜蛋白结构;水牛ALK5基因在肺脏、垂体、下丘脑组织中不表达,在水牛大脑、肝脏、骨骼、卵巢、肌肉和心脏等12个组织细胞中具有不同程度的表达,其中卵巢中表达量最高,心脏和肾脏次之,肌肉表达量最低。说明试验成功地克隆了沼泽型水牛ALK5基因,其具备典型的TGF-β受体家族结构,表达具有一定的组织特异性。

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