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4份临床样品中羊口疮病毒F1L、B2L和GIF基因的进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 林裕胜 1 ; 刘维巍 1 ; 张龙 1 ; 江锦秀 1 ; 张靖鹏 1 ; 刘庆华 2 ; 胡奇林 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

2.福建农林大学动物科学学院

关键词: 羊口疮病毒;F1L基因;B2L基因;GIF基因;进化分析

期刊名称: 福建农业学报

ISSN: 1008-0384

年卷期: 2022 年 006 期

页码: 748-753

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】研究2021年福建省部分羊场羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)分子流行病学情况。【方法】对2021年采集的4份病料经PCR鉴定ORFV阳性的临床样品分别克隆其F1L、B2L和GIF基因,将获得的克隆质粒送往测序公司进行测序,将测序拼接后的序列上传至GenBank数据库中,利用生物信息学软件进行对比分析。【结果】4份临床样品中ORFV的F1L、B2L和GIF基因核苷酸序列相似性分别为98.0%~98.8%、98.4%~99.5%和97.2%~99.6%;与国内流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.4%~99.4%、97.4%~99.9%和95.7%~99.0%;与国外流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.5%~98.6%、97.9%~98.9%和95.6%~98.0%;与德国D1701弱毒株核苷酸序列相似性分别为96.5%~96.8%、98.0%~98.7%和96.0%~96.4%,与NZ2参考株核苷酸序列相似性分别为97.7%~98.1%、97.5%~98.1%和95.9%~96.1%。遗传进化树结果显示4份临床样品中ORFV与吉林(NA17、SY17和CL18株)、福建SJ1株和印度MP株亲缘关系较近;与美国OV-IA82株、德国D1701弱毒株、新西兰NZ2参考株和中国疫苗株亲缘关系较远;表明当前流行毒株可能是本省毒株、国内吉林GZ18株和国外印度MP株的重组毒株。【结论】获得4份临床样品中ORFV B2L、F1L和GIF基因序列并上传至GenBank数据库中,丰富了ORFV相关基因序列的数据库,同时阐明福建省部分羊场当前ORFV的流行特征,为福建省今后有效防控Orf提供理论依据。

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