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四引物分子标记鉴定水稻光合效率基因TAC1的不同基因型

文献类型: 中文期刊

作者: 陈国鑫 1 ; 陈冰 1 ; 李昊澍 1 ; 赵坤龙 1 ; 秦冠男 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院生物技术研究所

关键词: 水稻(Oryza sativa);四引物;分子标记;光合效率;TAC1

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2020 年 007 期

页码: 2225-2232

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 水稻(Oryza sativa)的株型含株高、分蘖、穗型和叶型等性状,其表现与光合效率直接相关.一般地,籼稻(Oryza sativa ssp. xian)株型松散,而粳稻(Oryza sativa ssp. geng)更为紧凑.松散型的籼稻自身遮蔽少,通风好,植株光合效率高;紧凑株型的粳稻适应密植,通过提高单位面积植株数量提高总体光合效率.控制籼粳稻分蘖角度差异的主效基因是TAC1基因.相比TAC1xian,发生在tac1geng的3'非翻译区(3'UTR)的A→G突变导致mRNA稳定性下降,从而影响了粳稻的株型.2个等位基因分别属于单株高光效基因型和整体高光效基因型,处于杂合状态下还可互补,因此建立可精确选择TAC1等位基因的分子标记在育种实践中意义重大.本研究利用扩增受阻突变系统(amplification refractory mutation system, ARMS)的原理,开发出包含4条引物的共显性分子标记,鉴定TAC1的功能单核苷酸多态性(functional nucleotide polymorphism, FNP).该分子标记命名为tac1fnp,同TAC1完全连锁,一次PCR反应即可精确区分2种等位基因及杂合基因,有助于水稻的高光效分子标记辅助选择育种.

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