文献类型： 中文期刊
作者： 常远 1 ; 吴苏亭 2 ; 杨毅荣 2 ; 张禹函 2 ; 秦冠男 3 ;
作者机构： 1.中国科学院亚热带农业生态研究所/亚热带农业生态过程重点实验室
2.中国农业科学院生物技术研究所
3.中国科学院亚热带农业生态研究所
关键词： 水稻;分子标记;抽穗期;成花素;高光效基因;Hd3a
期刊名称： 杂交水稻
ISSN： 1005-3956
年卷期： 2020 年 004 期
页码： 75-80
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 水稻的抽穗期关乎水稻的光合效率、适应季节和种植范围,其表现直接决定了水稻能否高产稳产.Hd3a编码的成花素是水稻抽穗调控通路中的关键因子,在短日照下促进抽穗,长日照下推迟抽穗.Hd3a包含多个等位基因,其中来自aus稻品种Kasalath的hd3aKasa相比来自温带粳稻品种日本晴(Nipponbare)的Hd3aNip,在第4个外显子处有2个连续的碱基突变(CC→AA),使得hd3aKasa的功能强于Hd3aNip.hd3aKasa是高光效基因型,一般携带hd3aKasa的水稻品种产量更高,但会导致水稻开花推迟,可能影响其正常生产;而杂合态的Hd3aNip/hd3aKasa则表现出产量高和抽穗延迟适中,相比2种纯合基因型更加有利.由于Hd3a的不同等位基因各具优势,处于杂合状态下还可互补,因此建立可精确选择Hd3a等位基因的分子标记在育种实践中意义重大.本研究利用扩增受阻突变系统(Amplification refractory mutation system,ARMS)的原理,开发出包含4条引物的共显性分子标记hd3afnp,鉴定Hd3a的功能单核苷酸多态性(Functional nucleotide polymorphism,FNP).hd3afnp同表型完全连锁,1次PCR反应即可精确区分2种纯合等位基因型及其杂合基因型,从而有助于水稻的高光效分子标记辅助选择育种.
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