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采用SLAF-seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点

文献类型： 中文期刊

作者： 王伟 1 ; 刘凡 1 ; 任莉 1 ; 徐理 1 ; 陈旺 1 ; 曾令益 1 ; 黄炳文 1 ; 方小平 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室

关键词： 甘蓝型油菜;霜霉病;分子标记;SLAF;SNP

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2016 年 38 卷 05 期

页码： 555-562

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 由寄生霜霉(Hyaloperonospora parasitica)引起的油菜霜霉病(downy mildew)是油菜主要病害之一。本研究通过将抗霜霉病和感病亲本油菜杂交、F_1自交,得到F_2分离群体,构建抗、感病混池,采用BSA和SLAF(specific length amplified fragment sequencing)技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性相关分子标记。参考已公布油菜(Brassica napus)基因组设计酶切方案,构建SLAF文库并进行双端测序,共开发出132 519个SLAF标签,再通过分析SLAF标签的多态性,检测到264 256个SNP位点。利用SNP-index方法定位关联区域,分析关联区域内的基因在两个亲本之间SNP,对这些SNP进行变异的注释,发现2个非同义突变的SNP,分别是BDsnp01和BDsnp02。经验证,这2个SNP位点是与霜霉病抗性相关的并且在亲本和F2中稳定遗传。使用SNAPER软件设计2对特异引物能够利用电泳直接检测这两个SNP。

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