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亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙润润 1 ; 王园园 1 ; 郭新磊 1 ; 秦腾飞 1 ; 张金宝 1 ; 金翠萍 1 ; 董涛 1 ; 王清连 1 ;

作者机构： 1.河南科技学院现代生物育种河南省协同创新中心;中国农业科学院蔬菜花卉研究所

关键词： 亚洲棉;KNOX基因;进化分析;基因结构;组织表达

期刊名称： 中国棉花

ISSN： 1000-632X

年卷期： 2019 年 12 期

页码： 15-22

摘要： 为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因(GaKNOX1-GaKNOX23)。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HOX 4个典型结构域。GaKNOX基因进化聚类形成两大分支:ClassⅠ和ClassⅡ。转录组数据分析显示,GaKNOX12在开花后20 d的纤维和胚珠中的表达量最高,说明它可能参与调控棉纤维次生壁形成过程。本研究在亚洲棉全基因组水平上鉴定KNOX基因家族并进行生物信息学分析,为进一步研究KNOX基因在棉花中的调控作用奠定基础。

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