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雷蒙德氏棉KNOX基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 孙润润 1 ; 秦腾飞 1 ; 王园园 1 ; 刘用生 1 ; 郭新磊 2 ; 余春丽 1 ; 王清连 1 ;

作者机构: 1.河南科技学院生命科技学院现代生物育种河南省协同创新中心河南省棉麦分子生态与种质创新重点实验室

2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

关键词: 雷蒙德氏棉;KNOX基因;进化分析;基因结构;表达模式

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 006 期

页码: 1763-1773

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究KNOX基因家族在棉花生长发育中的调控作用,本研究以雷蒙德氏棉为材料,利用生物信息学的方法全基因组鉴定KNOX家族成员,并对其保守结构域、进化模式、染色体定位、基因结构和基因表达情况进行分析。共鉴定到22个KNOX基因,分布于10条染色体上,其中13个基因发生了片段复制。除GrKNOX9和GrKNOX15外,其余GrKNOX蛋白均含有KNOX1,KNOX2,ELK和HOX四个典型结构域。Gr KNOX基因家族进化聚类成两组:ClassⅠ和ClassⅡ。ClassⅠ组包含13个基因,ClassⅡ组含有9个基因。GrKNOX基因在叶片、花瓣、开花后10、20、30和40 d的种子中的表达分析显示,ClassⅠ组成员表达模式差别较大,ClassⅡ组成员表达模式较相似。GrKNOX12、GrKNOX1、GrKNOX17、GrKNOX2、GrKNOX11、GrKNOX3和GrKNOX22在测定的组织中表达量均较高;GrKNOX6、GrKNOX16和GrKNOX19在开花后20、30和40 d的种子中表达量较高,推测这3个基因参与调控棉花种子发育过程。本研究为进一步探究KNOX基因家族在棉花中的功能及进化模式提供科学依据。

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