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寒地苹果资源遗传多样性及群体结构的SSR标记分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘畅 1 ; 郭劲鹏 2 ; 高源 3 ; 胡颖慧 1 ; 杨悦 1 ; 宋宏伟 4 ; 卜海东 1 ; 于文全 1 ; 王昆 3 ; 顾广军 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院牡丹江分院

2.黑龙江省林业科学院牡丹江分院

3.中国农业科学院果树研究所

4.吉林省农业科学院果树研究所

关键词: 寒地苹果资源;荧光SSR标记;遗传多样性;聚类分析;群体结构

期刊名称: 中国果树

ISSN: 1000-8047

年卷期: 2023 年 005 期

页码: 15-22

收录情况: 北大核心

摘要: 对49份寒地苹果资源采用荧光SSR分子标记技术,并利用GenAlEx 6.501软件进行遗传多样性分析,利用NTSYS 1.2软件进行聚类分析,利用STRUCTURE 2.3.4软件进行群体结构分析。结果表明:20对SSR引物通过DNA扩增共检测出278个多态性等位基因,平均多态性等位基因数为13.850,平均有效等位基因数为6.649,香农多样性指数为2.065,观察杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.569和0.799,具有较高的遗传多样性。楸子群体与中国苹果群体间遗传距离最小,为0.261,楸子群体与西洋苹果群体间遗传距离最大,为0.411,属于中度分化。基于UPGMA遗传距离的聚类分析,在遗传距离0.80处49份材料可以分成2个类群,第Ⅰ类包括18份资源,全部是中国苹果群体;第Ⅱ类包括31份资源,其中楸子群体10份,中国苹果群体16份,西洋苹果群体5份。在遗传距离0.81处,第Ⅰ类进一步分为Ⅰa和Ⅰb两个亚类,分别包含5份和13份资源。群体结构分组与聚类分析有相似的结果,发现遗传距离和类群归属与地理位置并不完全相关,各群体间存在基因渗透。

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