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基于F2和RIL群体鉴定棉花抗黄萎病主效QTL

文献类型: 中文期刊

作者: 赵云雷 1 ; 王文菊 1 ; 陈伟 1 ; 王海红 2 ; 朱喜霞 2 ; 杨继华 3 ; 鲁宁宁 1 ; 赵佩 1 ; 桑晓慧 1 ; 崔艳利 1 ; 敦磊 1 ; 王红梅 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室/棉花生物育种及产业技术国家工程研究中心

2.安阳市殷都区农业农村局

3.山东众力棉业科技有限公司

关键词: 棉花;黄萎病;QTL定位;重组自交系;基因挖掘

期刊名称: 棉花学报

ISSN:

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 101-116

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】通过对棉花抗黄萎病性状进行数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位,鉴定可以应用于育种实践的能稳定检测到的主效QTL,为棉花抗黄萎病遗传改良奠定分子基础。【方法】以抗黄萎病品种中植棉2号和感黄萎病品种冀棉11号为亲本杂交的F2群体和重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体作为作图群体,在对2个群体进行多环境黄萎病抗性鉴定和简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记检测的基础上进行遗传连锁图谱构建,利用完备区间作图法进行QTL定位,并对获得的主效QTL置信区间进行候选基因挖掘。【结果】在F2:3家系和RIL群体中共检测到7个抗黄萎病QTL,能够在多个环境条件下重复检测到的QTL有4个,包括q VW-D05-1、qVW-D05-2、q VW-D05-4和qVW-D05-5。共线性分析表明上述4个QTL集中分布于D05染色体上2 293 776~3 205 058 bp和62 407 897~62 582 344 bp 2个区域。4个抗性QTL的聚合可以显著降低棉花黄萎病病情指数。qVW-D05-1在多个环境中的表型变异解释率均在10%以上,为抗黄萎病主效QTL。对qVW-D05-1置信区间内的基因进行了功能注释、黄萎病菌诱导后的表达模式分析和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变异分析,初步推测Ghir_D05G038990、Ghir_D05G039060、Ghir_D05G039100、Ghir_D05G039110和Ghir_D05G039130为可能控制棉花黄萎病抗性的候选基因。【结论】在不同环境中共检测到7个抗黄萎病QTL,其中4个QTL被重复检测到,在主效QTL q VW-D05-1区间内筛选获得5个棉花抗黄萎病候选基因。这些稳定的抗黄萎病相关的QTL及其候选基因可应用于棉花抗黄萎病性状的分子标记辅助选择育种。

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