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萝卜TALE转录因子家族的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵伟 1 ; 李锡香 1 ; 王海平 1 ; 贾会霞 1 ; 宋江萍 1 ; 阳文龙 1 ; 张晓辉 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业农村部园艺作物生物学与种质创制综合重点实验室农业农村部蔬菜作物基因资源与种质创制北京科学观测实验站

关键词： 萝卜;TALE基因家族;基因结构;进化分析;组织表达

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 343-358

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TALE (three-amino acid loop extension)转录因子在植物生长发育及细胞分化过程中起重要作用。在多种植物中均已鉴定出TALE转录因子的家族成员,但是萝卜TALE转录因子家族的研究鲜有报道。文中通过生物信息学手段在象牙白萝卜全基因组中鉴定出了分布于9条染色体上的33个TALE家族基因。研究结果显示,该家族中除与拟南芥KNATM同源的基因Rsa10037940外,其余基因均含有编码HOX保守结构域的序列。这些基因含有4–6个外显子。萝卜的33个TALE基因与拟南芥中的17个同源基因存在共线性关系。33个TALE基因启动子区的顺式元件中包含大量逆境响应元件。表达特性分析显示,该基因家族BELL亚家族内有4个基因在根内表达量较高,KNOX亚家族内有2个基因在薹和愈伤中表达量较高。该家族不同亚型成员之间的蛋白3D结构高度相似。编码蛋白均为弱酸、有亲水性。萝卜TALE基因家族在进化上较为保守,分化上与拟南芥存在一致性,与水稻差异较大。本研究为开展萝卜中TALE转录因子的生物学功能研究提供了重要参考。

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