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利用流式细胞术测定大额牛基因组大小的研究

文献类型: 中文期刊

作者: 贤明 1 ; 陈燕 1 ; 梁永虎 1 ; 宋禹昕 1 ; 牛红 1 ; 张文刚 1 ; 夏江威 1 ; 张天留 1 ; 许尚忠 1 ; 张路培 1 ; 高会江 1 ; 李俊雅 1 ; 高雪 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

关键词: 大额牛;基因组大小;流式细胞术

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2018 年 12 期

页码: 5214-5219

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 运用流式细胞术(FCM)测定大额牛基因组大小,并比较大额牛和普通牛基因组大小,为大额牛基因组学研究及其分类地位提供科学依据。分别提取人白细胞和鸡红细胞作为待选内参,用FCM测定经碘化丙啶(PI)染色的待选内参与大额牛白细胞的混合样品,通过比较大额牛与待选内参的荧光强度和DNA含量峰值的倍数关系,筛选出测定大额牛基因组大小最佳的标准内参,以此测定计算大额牛基因组大小;并比较大额牛和普通牛基因组大小关系。研究结果表明鸡红细胞是测定大额牛基因大小最佳的标准内参;以鸡红细胞(2C=2.5 pg)为参照,大额牛细胞核DNA含量C=2.780 9 pg,基因组大小为2.719 7×10~9 bp;大额牛与普通牛测定结果比较发现,大额牛基因组比普通牛基因组小。本研究筛选出测定大额牛基因组大小的最佳标准内参,并运用流式细胞术首次测定了大额牛基因组大小,证明了大额牛基因组较普通牛基因组小。本研究的结论将为后续大额牛De novo测序组装以及基因组学相关研究提供参考,也为确定大额牛进化提供科学依据。

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