文献类型: 中文期刊
作者: 祁云霞 1 ; 刘永斌 2 ; 荣威恒 2 ;
作者机构: 1.内蒙古农业大学动物科学学院
2.内蒙古自治区农牧业科学院
关键词: RNA-Seq;转录组;新一代测序技术
期刊名称: 遗传
ISSN: 0253-9772
年卷期: 2011 年 33 卷 11 期
页码: 1191-1202
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。RNA-Seq作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序,通过统计相关读段(reads)数计算出不同RNA的表达量,发现新的转录本;如果有基因组参考序列,可以把转录本映射回基因组,确定转录本位置、剪切情况等更为全面的遗传信息,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。文章主要介绍了RNA-Seq原理、技术特点及其应用,并就RNA-Seq技术面临的挑战和未来发展前景进行了讨论,为今后该技术的研究与应用提供参考。
- 相关文献
[1]基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因. 王位,付绍印,何小龙,王艳欣,王月星,王标,刘斌,刘永斌,张文广. 2018
[2]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015
[3]基于RNA-Seq技术的向日葵油酸形成的转录组学分析. 于海峰,韩平安,李美娜,陈阜,郭树春,李素萍,张艳芳,赵建军,闫明霞. 2018
[4]基于RNA-Seq的向日葵脂肪酸合成基因筛选与分析. 郭树春,张艳芳,李素萍,邵盈,邢慧军,于海峰. 2023
[5]马铃薯萌芽出苗期根系对水分胁迫的响应机理分析. 王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞. 2019
[6]基于RNA-Seq分析褪黑激素对绒山羊皮肤基因表达的影响. 丽春,付绍印,王建蒙,王位. 2018
[7]粳糯谷胚乳灌浆期差异表达基因富集分析. 李强,李涛,郭世华,白玉婷,李星聪. 2021
[8]植物提取物复合制剂缓解奶牛乳腺上皮细胞炎症反应的分子机制. 张腾龙,郭晨阳,宋洁,敖长金,王丽芳. 2023
[9]不同耐旱性紫花苜蓿干旱胁迫下生理响应和转录调控的差异研究. 陈力,王靖,邱晓,孙海莲,张文浩,王天佐. 2023
[10]玉米发芽期响应盐胁迫的转录组分析. 王星哲,武悦,王艺煊,王瑞莲,周文新,李瑞莲,陈阳. 2023
[11]RNA-Seq of Agropyron mongolicum Keng in response to drought stress. Ma, Yanhong,Yu, Xiaoxia,Yu, Zhuo,Li, XiaoLei,Sun, Fengcheng,Li, Xiaodong. 2018
[12]Regulatory pathway analysis of coat color genes in Mongolian horses. Li, Bei,Zhao, Yiping,Bai, Dongyi,Shiraigo, Wunierfu,Zhao, Qinan,Manglai, Dugarjaviin,He, Xiaolong. 2017
[13]Large-scale transcriptome comparison of sunflower genes responsive to Verticillium dahliae. Guo, Shuchun,Zuo, Yongchun,Wu, Chengyan,Su, Wenxia,Jin, Wen,Li, Qianzhong,Guo, Shuchun,Zhang, Yanfang,Yu, Haifeng,An, Yulin,Zuo, Yongchun. 2017
作者其他论文 更多>>
-
雄激素受体及共调节因子在睾酮调节绵羊附睾GPX5表达中的作用分析
作者:栾兆进;赵勇超;许娇霞;刘永斌;张家新
关键词:附睾上皮细胞;谷胱甘肽过氧化物酶5;睾酮;雄激素受体;共调节因子
-
饲粮添加酵母培养物对小尾寒羊屠宰性能及肌内氨基酸和功能成分的影响
作者:王力伟;刘永斌;赵杰;王标;特日格勒;何小龙;付绍印;姜丽丽;唐雅茹;何江峰
关键词:酵母培养物;小尾寒羊;超高效液相色谱串联三重四极杆质谱(UPLC-QqQ-MS);氨基酸;功能成分;肌肉
-
影响绵羊肉质因素的研究进展
作者:马凤英;张景萍;付绍印;刘在霞;韩程志;张文广;王宇;刘永斌
关键词:绵羊;肉品质;嫩度;风味;遗传因素;营养因素
-
绵羊繁殖相关编码RNA和非编码RNA的研究进展
作者:刘在霞;张景萍;付绍印;何小龙;王标;何江峰;白音巴图;韩程志;马凤英;张文广;石彩霞;刘永斌
关键词:绵羊;繁殖性状;编码RNA;非编码RNA
-
饲草燕麦的营养特性及其在反刍动物生产中的应用研究进展
作者:何江峰;王力伟;苏少锋;郝麒麟;刘红葵;贠娜娜;刘永斌;赵杰
关键词:饲草燕麦;营养特性;家畜;应用
-
附睾尾液对绵羊精液冷冻保存的影响
作者:张玮航;史静茹;王震;白雪;张健;徐冰冰;刘虹夫;刘永斌;张家新
关键词:湖羊;精液冷冻;稀释液;附睾尾液;精子活力
-
绵羊褐色脂肪活性影响因素的研究进展
作者:方勤圆;付绍印;王标;何小龙;何江峰;王力伟;陈欣;张林;王大清;马跃军;张立岭;刘永斌
关键词:褐色脂肪;解偶联蛋白1(UCP1);产热;能量代谢