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花魔芋NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 魏环宇 1 ; 魏薇 1 ; 杨敏 1 ; 裴卫华 1 ; 赵建荣 1 ; 钟宇 1 ; 刘佳妮 1 ; 陈泽斌 1 ; 陈海如 1 ; 余磊 1 ;

作者机构： 1.云南农业大学植物保护学院;昆明学院农学院云南省都市特色农业工程技术研究中心;云南省农业科学院农业环境资源研究所

关键词： 魔芋;NBS-LRR;抗病基因同源序列

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 23 期

页码： 7721-7726

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 分离和分析花魔芋的抗病基因同源序列(resistance gene analogs, RGAs),为魔芋抗病相关基因的克隆和分析提供了机遇。本研究利用生物信息学手段,参考已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域筛选并合成了4对简并引物,从花魔芋的基因组DNA中扩增出4条NBS-LRR类抗病基因同源序列。序列分析表明,这4条RGAs序列均不同程度地含有NBS保守域的典型特征。Blast X分析发现,获得的4条魔芋RGAs与已知植物RGAs的氨基酸序列相似性为55%～76%。同源进化分析表明,这些魔芋RGAs均属于non-TIR-NBS-LRR类且可以分成3个亚类。本研究通过分子克隆技术获得花魔芋的抗病基因同源序列,为利用同源克隆技术克隆魔芋抗病基因作出探讨,为培育抗病新品种及抗病转基因育种提供参考。

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