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敖鲁古雅驯鹿SRY基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何金明 1 ; 鞠妍 2 ; 邢秀梅 2 ; 王磊 2 ; 董依萌 2 ; 鞠贵春 1 ;

作者机构： 1.吉林农业大学动物科学技术学院

2.中国农业科学院特产研究所

关键词： 敖鲁古雅驯鹿;SRY基因;cDNA序列;生物信息学分析;系统进化分析

期刊名称： 吉林农业大学学报

ISSN： 1000-5684

年卷期： 2022 年 44 卷 001 期

页码： 97-103

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对敖鲁古雅驯鹿SRY(Sex-determiningregion of Y-chromosome)基因的cDNA序列进行测序及初步生物信息学分析.运用RT-PCR技术从敖鲁古雅驯鹿鹿茸组织中扩增SRY基因的cDNA序列,利用生物信息学软件对敖鲁古雅驯鹿SRY基因的cDNA序列及蛋白质结构进行分析,同时构建系统发育树.结果表明:扩增的敖鲁古雅驯鹿SRY基因的cDNA序列与GenBank数据库中登录的驯鹿SRY基因的cDNA序列(登录号AB247629.1)一致,全长690 bp.敖鲁古雅驯鹿SRY基因编码229个氨基酸;敖鲁古雅驯鹿SRY蛋白无信号肽和跨膜结构;结合其二级结构和结构域预测分析,SRY蛋白的二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,具有HMG结构域.通过构建NJ系统发育树,发现敖鲁古雅驯鹿与白尾鹿之间的亲缘关系相对较近.研究结果为深入探索敖鲁古雅驯鹿SRY基因的生物学功能提供了基础参考.

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