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棉花FT基因的特征和表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘春艳 1 ; 刘杰 2 ; 陈伟 3 ; 朱守鸿 3 ; 李燕 3 ; 曹新川 2 ; 何良荣 2 ; 张永山 3 ;

作者机构: 1.刘春艳

2.塔里木大学植物科学学院

3.中国农业科学院棉花研究所

关键词: 陆地棉TM-1;GhFT基因;不同组织;表达量

期刊名称: 塔里木大学学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 003 期

页码: 61-70

收录情况: CSTPCD

摘要: 利用生物信息学方法对13个棉种(二倍体棉8个、四倍体棉5个)的FT基因进行鉴定,并对其序列特征、进化关系、基因结构、蛋白结构、顺式作用元件进行分析;以陆地棉TM-1为试验材料,予以3种不同的光周期处理,利用qRT-PCR技术对陆地棉中的FT基因(GhFT基因)的时空表达特征进行定量验证。结果表明,13个棉种共获得18个FT基因,并且这些FT基因的理化性质差异不大,转录本长度普遍为525 bp,编码蛋白质长度为174个氨基酸,等电点介于6.73和9.45之间,平均分子量为19.56 kD;系统进化分析显示18个FT基因分为2组,组Ⅰ仅有2个成员,组Ⅱ包含16个成员;蛋白结构分析发现,所有FT基因均含有4种模体,具有相似的功能,同一组的FT基因含有相同的保守结构域;基因结构分析发现,同一类群的基因所含外显子和内含子数量相同,结构相似。田间自然光照条件下,GhFT基因在棉花各组织中的表达量存在较大差异,在苞叶和萼片中优势表达,在根、下胚轴中几乎不表达;长日照条件下(昼16 h/夜8 h),GhFT基因在叶片中的表达随着叶龄的增长而增强;24 h内GhFT基因在叶片和根中的表达量变化呈昼夜节律变化,GhFT基因长日照处理下叶片中的表达量显著高于根中的表达量,而在短日照(昼8 h/夜16 h)处理下相反。本试验旨在为研究GhFT基因在棉花发育调控中的作用提供参考。

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