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基于SSR标记的花菜类作物遗传多样性及群体结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 卢俊浩 1 ; 张婷 2 ; 张鹏 3 ; 木万福 4 ; 杨龙 4 ; 张建华 5 ; 黄晓蓉 1 ; 寸婕 1 ; 管俊娇 5 ;

作者机构: 1.云南大学资源植物研究院

2.云南省种子管理站

3.云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所

4.云南省农业科学院热区生态农业研究所

5.云南省农业科学院粮食作物研究所

关键词: 花菜;SSR标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2022 年 35 卷 008 期

页码: 1887-1894

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]为了解花菜类种质的遗传基础,分析种质群体的亲缘关系,为花菜育种提供参考.[方法]选用22对SSR引物,利用毛细管电泳荧光检测技术对96份花菜类种质材料进行遗传多样性分析,根据Nei's遗传距离和非加权配对法(UPGMA)进行聚类分析以及以Structure软件的混合模型聚类法推断材料构成群体的遗传结构.[结果]22对引物在96份材料中共扩增出91个等位位点,平均每对引物为4.136个.从22对引物中筛选出了 10对条带清晰、稳定性好的多态性引物,可用于花菜类作物种质资源的鉴定和研究.根据花球性状,将材料分为青花菜(24份)以及花椰菜(72份)2个组群,经多态性分析,2个组群的观察等位基因数值(Na)分别为2.727和3.091;有效等位基因数(Ne)分别为1.910和1.841;Shannon's指数(I)分别为0.675和0.667,说明这2个组群的遗传多样性均不够丰富.聚类分析也将96份材料分为2个组群,第I组为24份青花菜材料,包括1份西兰苔杂交种和23份青花菜杂交种;第Ⅱ组为72份花椰菜材料,包括29份花椰菜自交系、36份花椰菜杂交种和7份花椰菜主栽品种.花椰菜自交系被分到了 4个亚群,但在各亚群中材料之间的遗传距离较小,杂交组配时,选用不同亚群的自交系进行组配,以获得更大的杂交优势.群体结构分析中,当K=2时,AK出现明显的峰值,最大值为1658.48,为最佳群体组群数,与聚类分析结果基本一致.且96份材料的Q值均大于0.6,说明该花菜资源的遗传结构较为单一.[结论]所参试材料种质群体内遗传多样性不够丰富,遗传背景单一,亟需重视对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用,加强种质材料共享和交流,促进花菜种业发展.

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