文献类型： 中文期刊

作者： 刘昕彤 ¹ ; 申子萌 ² ; 张琦 ¹ ; 张西宁 ¹ ; 陶艳昵 ¹ ; 李志烨 ¹ ; 王希 ³ ; 赵春雷 ¹ ;

作者机构： 1.黑龙江大学现代农业与生态环境学院/中国农业科学院甜菜研究所

2.中资蓝天生态科技(北京)有限公司

3.黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江省甜菜工程技术研究中心

关键词： 甜菜;增殖细胞核抗原;基因克隆;编码区结构;生物信息学

期刊名称： 中国糖料

ISSN： 1007-2624

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 16-25

摘要： 本文旨在利用分子标记位点克隆糖用甜菜（Beta vulgaris L.）中的BvPCNA-like基因的基因组位点及完整的编码区（Coding sequence, CDS）,并对该CDS在基因组中的结构进行分析与验证，为进一步研究该基因的功能奠定基础。利用甜菜EST-SSR标记BvRE049,以糖用甜菜种质‘DP02’（标记检测阳性）为材料，通过电子克隆策略获得标记相关基因的基因组位点，进而克隆基因CDS片段；预测CDS在基因组中的外显子和内含子个数及内含子剪接位点分布范围，并设计PCR引物组合对以上结构进行验证；同时用在线生物信息学分析软件分析该基因产物的基本特征。克隆获得了甜菜基因BvPCNA-like的编码区，全长1 164 bp,编码产物含387个氨基酸，分子量约42 736.25 Da,等电点约4.46,在基因组中，该基因由3个内含子分隔成4个外显子。本研究克隆了BvPCNA-like基因的完整编码区，预测并验证了其在基因组位点中的结构，为进一步深入研究BvPCNA-like基因在甜菜体内的功能奠定了基础。