文献类型: 中文期刊
作者: 马子淞 1 ; 赵春雷 1 ; 王希 1 ; 李彦丽 1 ; 贾海伦 2 ; 丁广洲 1 ; 陈丽 1 ;
作者机构: 1.黑龙江大学现代农业与生态环境学院
2.黑龙江大学国家糖料改良中心
关键词: 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK);甜菜;生物信息学分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2025 年 23 卷 001 期
页码: 60-70
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: MAPK是真核细胞中普遍存在的一种信号转导模块因子,在植物的免疫应答和发育分化等过程中发挥重要的作用。本研究筛选鉴定甜菜MAPK (丝裂原活化蛋白激酶)基因家族的成员,分析其蛋白保守结构域、基因结构、进化关系、染色体定位、蛋白互作和3D结构。通过生物信息学手段共筛选鉴定到7个甜菜MAPK家族成员,其Gene ID分别为LOC104887071、LOC104893685、LOC104892250、LOC104889027、LOC-104903118、LOC104907978和LOC104889438。此外,MAPK家族基因不均匀地分布在4条染色体上,其基因编码的蛋白包含366~604个不等的氨基酸,其分子量介于42 144.29~68 964.33 Da之间,等电点介于5.40~8.85,属于弱酸性和弱碱性蛋白,外显子数量4~11个,BVMAPK2和BvMAPK6的T-LOOP环为TDY,亚细胞定位多数位于细胞质上。分析蛋白基序11个,其中模体6为T-LOOP。在假定启动子区预测的顺式作用元件表明甜菜MAPK家族受生物和非生物胁迫及激素的影响。本研究为利用甜菜MAPK家族基因的功能提供参考,为甜菜育种中的遗传改良提供理论依据。
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