文献类型: 中文期刊
作者: 陈敏氡 1 ; 王彬 1 ; 李永平 1 ; 刘建汀 1 ; 裘波音 1 ; 朱海生 1 ;
作者机构: 1.福建省农业科学院作物研究所福建省蔬菜遗传育种重点实验室
关键词: 西葫芦;CCD基因家族;生物信息学分析;表达分析
期刊名称: 西北植物学报
ISSN: 1000-4025
年卷期: 2022 年 42 卷 007 期
页码: 1124-1132
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 类胡萝卜素裂解双加氧酶(carotenoid cleavage dioxygenase,CCD)是类胡萝卜素氧化裂解途径中的关键酶,在植物生长发育、香气形成及胁迫响应等过程中均发挥着重要作用.该研究运用生物信息学方法从西葫芦全基因组中鉴定出13条具有完整RPE65保守结构域的CCD基因,为进一步解析CCD基因家族在西葫芦中的功能奠定基础.结果表明:(1)聚类分析显示,13个西葫芦CCD基因编码的蛋白可分为CCD1、CCD4、CCD7、CCD8、NCED、CCD1-like共6个亚组,且CCD8和CCD7亚组与其他家族成员的遗传距离较远.(2)顺式作用元件预测分析发现,CCD基因启动子中含有光信号、激素、环境胁迫和生长发育响应元件.(3)转录组数据分析显示,CCD家族基因具有组织表达特异性,其中3个CCD基因在组织中不表达,CpCCD1基因在叶和果实中显著高表达.(4)在果实发育过程中,8个CCD基因呈现上调表达,2个CCD基因呈现下调表达,其中CpCCD1、CpCCD4a、CpC-CD4b、CpCCD8a这4个CCD基因在果实膨大生长期或成熟期出现显著高表达,推测它们可能在西葫芦果实发育过程中具有重要的调控作用.
- 相关文献
[1]西葫芦NCED基因家族鉴定及其响应干旱胁迫分析. 刘建汀,叶新如,张前荣,李永平,温庆放,朱海生. 2023
[2]西葫芦CpActin内参基因的分离及其作为内参基因的初步应用. 刘建汀,朱海生,王彬,李永平,陈敏氡,张前荣,温庆放. 2019
[3]西葫芦9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶CpNCED2基因的克隆及其干旱响应模式研究. 刘建汀,曾美娟,温文旭,王彬,陈敏氡,叶新如,朱海生,温庆放. 2021
[4]基于转录组的‘三月李’及其红肉突变体ARF基因家族鉴定及分析. 方智振,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,叶新福. 2019
[5]三月李及其红肉突变体Aux/IAA家族基因鉴定及分析. 方智振,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,叶新福. 2020
[6]基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析. 方智振,林炎娟,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,叶新福. 2020
[7]普通丝瓜GH3基因家族全基因组鉴定及表达分析. 曾美娟,刘建汀,李祖亮,陈敏氡,叶新如,王彬,朱海生,温庆放. 2022
[8]不同氮浓度下茶树氮合成关键酶基因的表达分析. LIN Zhenghe,林郑和,ZHONG Qiusheng,钟秋生,CHEN Changsong. 2014
[9]低温弱光对西葫芦幼苗生长生理指标的影响. 黄丽芳,刘建汀,王彬,温庆放,朱海生,林碧英. 2018
[10]西葫芦过氧化物酶POD1基因的分离及表达分析. 黄丽芳,刘建汀,王彬,温庆放,朱海生,林碧英. 2018
[11]利用SSR技术鉴定西葫芦杂交种子纯度. 朱海生,王彬,刘建汀,陈敏氡,李永平,张前荣,温庆放. 2019
[12]半番鸭POU1F1基因序列的克隆与生物信息学分析. 朱志明,陈晖,李盛霖,郑嫩珠,缪中纬. 2010
[13]花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析. 陈湘瑜,徐日荣,林栩松,唐兆秀. 2016
[14]莆田豆梨GPX基因克隆与生物信息学分析. 陈义挺,张长和,陈婷,陈招弟. 2015
[15]鳗鲡疱疹病毒FJ株ORF51基因的克隆及生物信息学分析. 李友娟,葛均青,林天龙. 2014
[16]猪嵴病毒非结构蛋白2C的生物信息学分析. 陈秋勇,胡崇伟,陈如敬,陈晓珞,林群群,陈鹏强,修金生. 2014
[17]乌鬃鹅α干扰素基因的克隆及生物信息学分析. 陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,施少华,傅秋玲,黄瑜. 2013
[18]菜用大豆蔗糖转运蛋白生物信息学分析. 张玉梅,胡润芳,林国强. 2018
[19]龙眼DlIKU1基因的克隆与功能分析. 姜帆,田真真,陈雪玮,郑少泉,陈亮. 2016
[20]鸭疫里默氏菌铁依赖抑制子基因的克隆及序列分析. 万春和,程龙飞,陈红梅,傅光华,施少华,黄瑜. 2014
作者其他论文 更多>>
-
20个丝瓜品种的花粉形态特征研究
作者:陈朝文;朱海生;凌永胜;郑雅超;方桂花;李扬;王智卿;林金秀;郑凯玲
关键词:丝瓜;花粉形态;电镜扫描;分类系统
-
辣椒不同栽培土壤/基质真菌群落结构特征分析
作者:马慧斐;朱海生;李永平;黄昊;康玉妹;温庆放;薛珠政
关键词:辣椒;无土栽培;基质;真菌群落结构;多样性
-
不同果肉厚度的苦瓜种质细胞大小和形态差异分析
作者:裘波音;李大忠;林珲;张前荣;温庆放;朱海生
关键词:苦瓜;果肉厚度;细胞大小;细胞形态
-
西葫芦NCED基因家族鉴定及其响应干旱胁迫分析
作者:刘建汀;叶新如;张前荣;李永平;温庆放;朱海生
关键词:西葫芦;NCED基因家族;生物信息学分析;干旱胁迫;表达分析
-
闽研6号苦瓜在三明永安示范种植表现
作者:李大忠;张前荣;林珲;裘波音
关键词:
-
茄子不同阶段花朵植物激素QQQ LC-MS质谱联用分析
作者:林珲;刘建汀;杨港华;陈继兵;黄建都;王益奎;朱海生;温庆放
关键词:茄子;花;植物激素;超高效液相色谱;质谱分析
-
闽研6号苦瓜周年栽培技术
作者:李大忠;张前荣;林珲;裘波音
关键词:苦瓜;闽研6号;周年栽培