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猪流行性腹泻病毒感染猪小肠上皮细胞miRNA表达谱分析及验证

文献类型: 中文期刊

作者: 张宸语 1 ; 陈佳宁 1 ; 温建新 1 ; 刘光亮 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室;青岛农业大学动物医学院

关键词: IPEC-J2;PEDV;miRNA;病毒复制

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2018 年 12 期

页码: 1095-1099

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)感染猪小肠上皮细胞(Porcine intestine epithelial cells J2,IPEC-J2)后对IPEC-J2的miRNA表达谱的影响,本实验将PEDV感染IPEC-J2,收获细胞并提取其总RNA,进行Hiseq高通量测序,构建感染组与未感染组的miRNA表达谱并进行聚类分析、GO(Gene ontology,GO)分析、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)代谢通路分析和差异分析,并通过过表达novel-miR-877 mimic和ssc-mi R-219a mimic观察PEDV对IPEC-J2复制的影响。结果显示显著差异表达的已知miRNA有45个,未知mi RNA有249个,从其中随机挑选了差异表达较显著的16个mi RNA并采用q PCR进行验证,结果显示与测序结果一致;对这些差异miRNA进行GO分析,结果显示其广泛参与生物过程、细胞成分和分子功能的调节;通过KEGG代谢通路分析显示miRNA也参与Jak-STAT、Toll样受体等信号通路的调节;通过对novel-miR-877和ssc-miR-219a的过表达,显示PEDV复制均受到显著抑制。本研究为探究miRNA在PEDV复制中的作用奠定了基础。

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