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水貂TYRP1基因的多态性与毛色性状的相关性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘琳玲 1 ; 岳志刚 1 ; 涂剑锋 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院特产研究所

关键词： 水貂;TYRP1基因;毛色;多态性;相关性分析

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2023 年 16 期

页码： 129-133+140

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究水貂TYRP1基因多态性与毛色性状的相关性，试验首先提取384只水貂的血液基因组DNA,然后对水貂TYRP1基因外显子2,3,4进行PCR扩增并测序，通过序列比对识别单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点并进行基因分型，统计SNP位点在不同品种水貂群体(红眼白水貂、银蓝水貂、短毛黑水貂和咖啡水貂)中的基因型频率和等位基因频率后进行遗传多样性分析，最后采用卡方(χ~2)检验对SNP位点基因型与毛色性状进行相关性分析。结果表明：TYRP1基因外显子3,4未识别到SNP位点，而外显子2识别到1个SNP位点(C777G位点),C777G位点在4个品种水貂群体中共存在3种基因型(CC型、CG型和GG型)。红眼白水貂群体的优势基因型为GG型，优势等位基因为G;银蓝水貂、短毛黑水貂和咖啡水貂群体的优势基因型均为CC型，优势等位基因均为C,其中短毛黑水貂群体的基因型全部为CC型，等位基因全部为C。C777G位点在红眼白貂和银蓝水貂群体中极显著偏离哈代-温格平衡状态(P<0.01),在咖啡水貂群体中处于哈代-温格平衡状态(P>0.05)。红眼白、银蓝和咖啡三个品种水貂TYRP1基因C777G位点为轻度多态(PIC<0.25),短毛黑水貂TYRP1基因C777G位点无多态性(PIC=0)。4个品种水貂TYRP1基因C777G位点的纯合度(Ho)在0.695 7(咖啡黑水貂)～1.000 0(短毛水貂)之间，杂合度(He)在0(短毛黑水貂)～0.304 3(咖啡水貂)之间，有效等位基因(Ne)在1.000 0(短毛黑水貂)～1.347 8(咖啡水貂)之间。C777G位点基因型与红眼白、银蓝和咖啡三个品种水貂毛色性状极显著相关(P<0.01)。说明TYRP1基因C777G位点可作为水貂毛色性状辅助选择的分子标记。

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