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根瘤菌侵染早期大豆差异表达miRNA的挖掘及调控分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姚思源 1 ; 孔祥莹 2 ; 祁平 2 ; 王晓波 1 ; 阎哲 2 ;

作者机构： 1.安徽农业大学农学院

2.中国农业科学院作物科学研究所/农业农村部粮食作物基因资源评价利用重点实验室/作物基因资源与育种全国重点实验室

关键词： 大豆;根瘤菌侵染;miRNA;共生固氮;调控分析

期刊名称： 大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2025 年 44 卷 003 期

页码： 1-10

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解大豆-根瘤菌共生互作早期地上组织和地下组织中miRNA的表达动态变化，采用高通量测序对根瘤菌侵染3 d大豆的根部和叶部组织的小RNA进行测序，筛选出差异表达的miRNA并通过qRT-PCR验证测序准确性，对靶基因进行预测和富集，并构建miRNA-gene调控网络以分析差异表达miRNA的功能。结果显示：共鉴定出1 618个在大豆中表达的miRNA,其中包括696个前期未被报道的miRNA。表达变化分析结果显示，共鉴定到87个被根瘤菌侵染显著调控的miRNA。qRT-PCR验证结果表明，miRNA表达情况与测序结果趋势一致。差异表达miRNA的靶基因预测显示，5 980个基因可能受到miRNA调控。GO和KEGG富集分析结果显示，受根瘤菌侵染调控的miRNA多通过抑制参与大豆物质合成代谢、能量运输、信号转导、免疫应答等相关的靶基因表达，从而参与大豆-根瘤菌共生关系的建立。研究结果为理解大豆的共生机制及miRNA在大豆与根瘤菌互作过程中的作用提供了有价值的数据信息。

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