文献类型： 中文期刊

作者： 吴传磊 ¹ ; 胡晓渝 ¹ ; 王伟 ¹ ; 苗龙 ¹ ; 白鹏宇 ¹ ; 王郭伋 ¹ ; 李娜 ¹ ; 舒阔 ¹ ; 邱丽娟 ² ; 王晓波 ¹ ;

作者机构： 1.安徽农业大学农学院

2.中国农业科学院作物科学研究所/农业农村部作物基因资源与遗传改良重大科学工程/农业农村部作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词： 大豆;生物信息学分析;分子标记;油分含量;基因聚合

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2024 年 57 卷 022 期

页码： 4402-4424

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】聚合大豆高油基因型旨在育种出更高含油量的品种，以提高经济效益和营养价值。为增加农业产出、降低加工成本、满足全球对植物油增长需求提供依据。【方法】利用生物信息学分析方法对Glyma.18G027100所在的C2基因家族在全基因组水平上进行鉴定，共鉴定出66个大豆C2基因家族成员，根据染色体位置命名为GmC2-01.1—GmC2-20.2。组织模式表达分析，在66个C2家族基因中共发现7个在籽粒中高表达基因（GmC2-03.6、GmC2-02.7、GmC2-07.2、GmC2-18.1、GmC2-18.4、GmC2-19.1和GmC2-20.2），为分析上述基因在大豆油分含量中的效应位点，从SFGB数据库中获得上述基因在编码区的SNP位点，2年油分含量相关分析表明，GmC2-18.1存在极显著影响油分含量的SNP位点。利用12份极端材料对GmC2-18.1编码区遗传多样性进行分析，在Wm82.a2.v1版本编码区2 038 273 bp处存在G/A变异调控种子油分含量，初步推测这个基因在籽粒发育或者营养物质积累中发挥作用。接着，对GmC2-18.1-^G/A基因结合已报道的功能基因GmSWEET39起始密码子上游225 bp的InDel自然等位变异位点、GmST1在编码区8 381 058处存在T/C自然等位变异位点、GmMFT在编码区在41 854 422 bp第三个外显子处存在A/C自然等位变异位点开发SNP/InDel分子标记，并通过2年1 200份来自全国三大生态区的大豆种质资源材料进行标记验证。【结果】方差分析结果表明，GmC2-18.1^-G、GmSWEET39^-Deletion、GmST1^-T和GmMFT^-A显著增加油分含量1.72、1.95、1.58和2.06个百分点（P<0.01）。进一步对上述基因进行聚合分析，结果表明，携带GmC2-18.1^-G、GmSWEET39^-Deletion、GmST1^-T和GmMFT^-A高油等位变异类型（PFAT-1）的大豆种子平均油分含量为22.89%，相较于携有GmC2-18.1^-A、GmSWEET39^-Insertion、GmST1^-C和GmMFT^-C低油等位变异类型（PFAT-14）大豆种子平均油分含量增加约4.5个百分点，对油分含量的贡献率约为21.69%。【结论】基于上述所开发标记，筛选出115份PFAT-1类型高油等位变异材料。