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Ceratotropis亚属基于SSR标记和ITS序列的分类与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马燕玲 1 ; 程须珍 1 ; 王丽侠 1 ; 王素华 1 ; 赵丹 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： Ceratotropis亚属;分类;SSR标记;ITS序列;进化

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2010 年 36 卷 09 期

页码： 1585-1595

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用SSR分子标记和ITS序列分析研究Ceratotropis亚属已鉴定的93份种质以及Vigna亚属的2份地方种和Glycine属的1份野生种,共8个种及亚种的96份材料的遗传差异。初步筛选出分布于11个连锁群(linkage group,LG)的74对小豆引物及14对黒吉豆引物和第9连锁群的5对绿豆引物,得到分辨力强的27对引物,平均PIC值为0.4914;UPGMA聚类分析,在DICE系数0.021处,将95份参试材料(除HAI_103)划分为两大类,第I类包括Ceratotropis组所有种质和3个"过渡"种质;第II类包括Angulares组所有种质,且小豆引物通用性最高,23对小豆引物的转移能力达88%以上。对参试材料中的28份典型种质进行ITS测序分析,比较序列间Kimura进化距离发现,V.minima和V.umbellata种间距离最小(0~0.005),V.radiata种内分化程度最高;利用MEGA4.0构建最大简约树(maximum parsimony,MP)和邻接树(neighbor-joining,NJ),将参试种质划分为3大类,这与形态学和SSR标记分类一致。

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