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DNA双链区的切割导致碱变性超螺旋质粒pBR322的分子内结节（英文）

文献类型： 中文期刊

作者： 田磊 1 ; 苏小运 2 ; 张臻峰 3 ; 黄熙泰 4 ;

作者机构： 1.中国人民解放军海军总医院普外科

2.中国农业科学院饲料研究所

3.中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室

4.南开大学生命科学学院

关键词： DNAⅣ;限制性内切酶;DNA拓扑异构酶;DNA结节;原子力显微镜

期刊名称： 生物化学与生物物理进展

ISSN： 1000-3282

年卷期： 2016 年 08 期

页码： 778-786

收录情况： SCI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 为进一步研究碱变性超螺旋D NA(Ⅳ型D NA;DNAⅣ)的结构,对碱变性质粒p BR322进行了酶学分析并利用原子力显微镜(AFM)对新形成的D NA结构进行了观察和比较.在所有已检测的限制酶中只有PstⅠ可以切割质粒p BR322的Ⅳ型DNA分子,说明在这种变性的DNA分子中仍存在少数完整的限制酶识别位点.与碱变性DNA分子的闭合环状结构相反,AFM成像的结果显示PstⅠ处理后的DNAⅣ分子均为开放结构,同时这种分子包含明显的DNA结节.与DNAⅣ分子相比,这种D NA分子的表观长度缩短了大约11%.有意思的是,大肠杆菌拓扑异构酶Ⅳ(一种Ⅱ型拓扑异构酶)也可以在p BR322 DNAⅣ分子中引入分子内结节,而这种结节D NA分子仍然保持闭合状态.AFM的结果表明上述两种结节的DNA分子在表观长度及结节结构的尺寸上均比较相似.这些发现证实,在碱变性的超螺旋DNA分子中仍然保留着一些长度较短的、含有特异性碱基配对的D NA双链区,而在这些区域内的D NA双链断裂可以导致D NA结节.

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