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基于高通量转录组测序技术构建猪脂肪沉积的lncRNA和miRNA相关ceRNA调控网络

文献类型： 中文期刊

作者： 刘怡冰 1 ; 邢凯 2 ; 敖红 3 ; 翟丽维 1 ; 刘华涛 1 ; 赵卿尧 1 ; 石咏 1 ; 李航 1 ; 马福平 1 ; 王楚端 1 ;

作者机构： 1.中国农业大学动物科学技术学院

2.北京农学院动物科学技术学院

3.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

关键词： 猪;脂肪沉积;非编码RNA;ceRNA

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2022 年 58 卷 008 期

页码： 106-112

收录情况： 北大核心

摘要： 脂肪沉积性状是养猪生产中的重要经济性状,也与生猪养殖的经济效益密切相关.课题组前期对3对具有极端背膘厚度的长白猪全同胞个体的背部皮下脂肪组织样本进行链特异性建库RNA测序和小RNA测序鉴定lncRNA和miRNA,通过差异表达分析,共得到220个lncRNA和18个miRNA在高、低背膘组间差异表达.本研究进一步分析它们的生物学功能,进行靶向关系预测和靶基因功能富集分析,并构建猪脂肪沉积的lncRNA和miRNA相关ceRNA调控网络.结果发现,差异表达lncRNA及miRNA靶基因能够显著富集到多个糖脂代谢相关的通路,如"脂肪细胞分化"、"糖酵解/糖异生"等.最终成功构建了一个与脂肪沉积过程密切相关的ceRNA调控网络,包含9个差异表达lncRNA,6个差异表达miRNA和25个靶基因.本研究结果为探究非编码RNA在猪脂肪沉积过程中的功能及其分子调控机制提供了新的思路.

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