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西藏4个绵羊品种SNP基因分型及群体结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 洛桑催成 1 ; 巴桑吉巴 1 ; 平措班旦 1 ; 王欣悦 2 ; 德庆卓嘎 1 ; 格桑加措 1 ; 次仁曲珍 1 ; 旦巴 3 ; 罗布桑布 4 ;

作者机构: 1.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所

2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

3.西藏日喀则市岗巴县农牧综合服务中心

4.西藏日喀则市康马县农牧综合服务中心

关键词: 藏系绵羊;SNP基因分型;群体结构;高密度芯片

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2024 年 003 期

页码: 138-141

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 藏系绵羊分布范围广泛,品种资源丰富,目前主要分为三大类群,但藏系绵羊群体结构不清。为分析藏系绵羊SNP位点及群体结构,实验利用Illumina Ovine SNP 600K商业化芯片对西藏阿旺绵羊、岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊等150只藏系绵羊进行了SNP基因分型,并通过PCA和NJ-tree等方法分析了藏系绵羊群体结构。SNP质控结果表明,共有147个个体符合质控条件,共获得456 418个SNP位点。群体结构分析表明,西藏地区的岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊分别聚为一类,而其他地区的藏系绵羊混乱聚集在一起。本实验研究结果为今后西藏当地绵羊遗传资源的鉴定和保护开发利用提供了理论基础和参考依据。

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