文献类型： 中文期刊
作者：
周妍
1
;
刁晨曦
2
;
张圆圆
2
;
于海波
2
;
陆涛峰
2
;
赵丽丽
2
;
陈洪岩
3
;
作者机构： 1.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室实验动物与比较医学创新团队;东北农业大学生命科学学院;牡丹江师范学院生命科学与技术学院
2.;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室实验动物与比较医学创新团队;东北农业大学生命科学学院;牡丹江师范学院生命科学与技术学院
3.;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室实验动物与比较医学创新团队;东北农业大学生命科学学院;牡丹江师范学院生命科学与技术学院;
关键词： SPF鸡;不同生长阶段;粪便菌群;16s rRNA;Illumina HiSeq 2500高通量测序
期刊名称： 实验动物与比较医学
ISSN： 1674-5817
年卷期： 2017 年 03 期
页码： 231-239
摘要： 目的提供SPF鸡不同生长阶段肠道菌群的组成及多样性数据。方法采集10日龄、12周龄、23周龄和52周龄SPF鸡粪便,利用Illumina HiSeq 2500高通量测序方法,对样品16S rRNA的两个高变区(V3-V4)进行测序分析,并进行了α-多样性指数、β-多样性指数和粪便群落特征分析。结果四个生长阶段粪便样品菌群具有相似的较高的丰富度和良好的均匀度,物种多样性无显著差异(P>0.05);厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度占95%以上;乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)、肠球菌属(Enterococcus)为优势菌属,不同时期丰度差异达显著水平(P<0.05)。结论四个生长阶段菌群组成多样,且优势菌群主要为有益菌。该实验结果能够为SPF鸡品质评定、健康监测和安全性评价提供依据。
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