文献类型： 中文期刊
作者： 刘振 1 ; 赵洋 1 ; 杨培迪 1 ; 成杨 1 ; 唐怀廷 2 ; 杨阳 1 ;
作者机构： 1.湖南省农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心湖南分中心
2.张家界西莲茶业有限责任公司
关键词： 茶树;三倍体;叶绿体基因组;基因组测序;系统发育关系;叶绿体SSR;‘西莲1号’
期刊名称： 茶叶通讯
ISSN：
年卷期： 2023 年 002 期
页码： 166-175
摘要： 三倍体茶树品种‘西莲1号’是桑植白茶产业发展的主推品种，与湖南现有茶树品种相比具有很强的特异性。为揭示‘西莲1号’的分类和演化地位，项目采用叶绿体（Chloroplast,cp）全基因组测序技术进行了‘西莲1号’全基因组测序，并对其所有的SSR标记进行了开发与筛选。结果表明：（1）‘西莲1号’叶绿体基因组全长为157 038 bp,GC含量为37.30%，为一个四分体结构，包括1个大的单拷贝（LSC）、一个小的单拷贝（SSC）和一对反向重复序列（IR），长度分别为86 612 bp、18 282 bp和26 072 bp。cpDNA共注释得到132个基因，其中unigenes有114个，包含80个编码基因，30个tRNA基因和4个rRNA基因。（2）共鉴定出245个简单序列重复（SSR），通过筛选有15个SSR具有较高的多态性。获得了cpDNA基因组20个氨基酸的偏好密码子，‘西莲1号’密码子偏好以A/T碱基结尾。（3）基因选择压力分析表明，与茶组其他资源相比，6个基因（accD、ndhC、petB、rpl16、rpoC1、rpoC2）可能处于正选择状态。（4）基于叶绿体基因组序列构建了基于22份茶组植物的系统发育树，聚类结果显示‘西莲1号’与其他栽培型茶树品种（Camellia sinensis var. sinensis）处于系统发育树的末端，属于进化的茶树资源类型。
- 相关文献
[1]茶树cpDNA测序及基于cpDNA序列的山茶属植物亲缘关系研究. 陈春梅,马春雷,马建强,刘声传,陈亮. 2014
[2]基于cpDNA序列的茶树及其近缘植物的亲缘关系研究. 陈春梅. 2014
[3]利用SSR标记研究甘蓝型油菜叶绿体基因组DNA多态性. 陈碧云,吕培军,许鲲,伍晓明. 2023
[4]拟南芥叶绿体SSR引物在甘蓝上的应用. 张扬勇,方智远,王庆彪,刘玉梅,杨丽梅,庄木,孙培田. 2011
[5]利用叶绿体SSR(cpSSR)标记区分三种Ogura胞质甘蓝雄性不育系. 王庆彪,张扬勇,方智远,刘玉梅,杨丽梅,庄木,孙培田. 2010
[6]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015
[7]文昌鸡线粒体控制区遗传多态性及系统进化分析. 章明,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,高玉时. 2016
[8]德化黑鸡线粒体DNA控制区全序列测定及起源研究. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,顾荣,葛庆联,高玉时. 2015
[9]基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系. 高玉时,贾晓旭,唐修君,唐梦君,樊艳凤,陆俊贤,顾荣,葛庆联,苏一军. 2015
[10]云龙矮脚鸡系统进化及遗传多样性的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015
[11]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析藏鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015
[12]基于线粒体标记的淮南麻黄鸡遗传结构及其遗传多样性分析. 黄胜海,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,葛庆联,高玉时. 2018
[13]边鸡遗传多样性及其起源进化的研究. 贾晓旭,唐修君,樊艳凤,陆俊贤,葛庆联,黄胜海,高玉时. 2018
[14]寿光鸡遗传多样性及其起源进化的研究. 贾晓旭,唐修君,樊艳凤,陆俊贤,葛庆联,黄胜海,高玉时. 2019
[15]石岐鸽mtDNA Cytb基因遗传多样性分析. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,叶俊文,樊艳凤,马尹鹏,李正晟,许小飞,高玉时. 2023
[16]清远麻鸡线粒体DNA细胞色素b基因遗传多样性分析. 贾晓旭,陆俊贤,张静,唐修君,樊艳凤,马尹鹏,高玉时. 2023
[17]慢生根瘤菌交叉结瘤与其系统发育关系的研究. 樊蕙,李俊,李力,曹凤明. 2001
[18]猪流行性腹泻病毒的分子流行病学研究. 陈建飞,王承宝,时洪艳,陈小金,张志榜,冯力. 2010
[19]藏鸡线粒体基因组特征及系统发育进化. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,马尹鹏,葛庆联,高玉时. 2021
[20]油菜叶绿体基因组研究进展. 蔡梦鲜,闫贵欣,伍晓明,李俊,宋伟林. 2013
作者其他论文 更多>>
-
单县羊肉汤特征风味物质鉴别与解析
作者：张泽宇;贾成立;刘振;李少博;张春江;帅庆辉;王新建;徐树兵;肖德志;张德权;王振宇
关键词：羊肉汤;香气属性;挥发性化合物;气相色谱-质谱联用;电子鼻
-
“一带一路”背景下农业科研院所与埃塞俄比亚合作成效浅析——以中国与埃塞俄比亚旱作玉米技术合作为例
作者：杨阳;赵璞;田玉;及增发;温之雨;刘粤阳;张桂山;马春红
关键词：农业科研院所;埃塞俄比亚;国际合作;抗旱玉米;“一带一路”倡议
-
早生优质高产绿茶茶树新品种‘湘茶研3号’选育研究
作者：杨阳;刘振;赵洋;杨培迪;成杨;璩馥榕
关键词：茶树品种;‘湘茶研3号’;早生;优质;高产;绿茶
-
"一带一路"背景下农业科研院所与埃塞俄比亚合作成效浅析
作者：杨阳;赵璞;田玉;及增发;温之雨;刘粤阳;张桂山;马春红
关键词：农业科研院所;埃塞俄比亚;国际合作;抗旱玉米;一带一路倡议
-
早生优质高产绿茶茶树新品种'湘茶研3号'选育研究
作者：杨阳;刘振;赵洋;杨培迪;成杨;璩馥榕
关键词：茶树品种;’湘茶研3号’;早生;优质;高产;绿茶
-
PTH 1-34对鹿茸间充质干细胞成骨机制的转录组学分析
作者：邢宝瑞;赵海平;李光玉;马泽芳;孙红梅;胡肖;谭展清;刘振
关键词：鹿茸;甲状旁腺素1-34;间充质干细胞;成骨诱导;转录组学
-
鹿茸成骨过程中骨保护素作用机制的研究
作者：邢宝瑞;刘振;赵海平;李光玉;孙红梅;李勋胜;周珏;姚程杰;马泽芳
关键词：骨保护素;梅花鹿;鹿茸间充质干细胞;成骨诱导
