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猪戊型肝炎病毒黑龙江分离株SWHLJ-BXBX全基因组序列的测定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李海 1 ; 王刚 2 ; 张交儿 2 ; 何希君 2 ; 刘永刚 2 ; 姜成刚 2 ; 王淑杰 2 ; 涂亚斌 2 ; 蔡雪辉 3 ;

作者机构: 1.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/动物疫病诊断中心

2.;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/动物疫病诊断中心

3.;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/动物疫病诊断中心;

关键词: 猪戊型肝炎病毒(HEV);Ⅳd基因亚型;序列分析;全基因组测序;序列特征;进化树

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2017 年 11 期

页码: 176-178

收录情况: 北大核心

摘要: 为了研究猪戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)黑龙江分离株SWHLJ-BXBX的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析,试验采用RT-n PCR、5'-RACE、3'-RACE方法和Megalign、MEGA 6等生物学软件对SWHLJ-BXBX的全基因组序列进行了研究。结果表明:SWHLJ-BXBX全基因组序列去除poly A后全长为7 240 bp,5'UTR有25个碱基,3'UTR全长为70 bp,ORF1编码1 707个氨基酸,ORF2编码674个氨基酸,ORF3编码114个氨基酸,进化树分析表明SWHLJBXBX属于HEVⅣd基因亚型。

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