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二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价

文献类型: 中文期刊

作者: 徐红星 1 ; 王国荣 1 ; 鲁艳辉 1 ; 杨亚军 1 ; 郑许松 1 ; 田俊策 1 ; 吕仲贤 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院农业部农产品信息溯源重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地;杭州市萧山区农业技术推广中心

关键词: 二化螟;内参基因;荧光定量PCR;基因表达

期刊名称: 中国水稻科学

ISSN: 1001-7216

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 75-84

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】筛选特定试验条件下二化螟(Chilosuppressalis)稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础。【方法】根据二化螟转录组测序结果挑选出11个候选基因,利用实时荧光定量PCR测定其在二化螟不同发育历期、不同组织、温度处理、杀虫剂处理、取食不同饲料、取食不同水稻、dsRNA处理和混合样品的表达量,利用RefFinder、BestKeeper、Ge Norm和NormFinder等软件和ΔC_t值对11个候选基因的稳定性进行评估。【结果】5种分析方法表明,在二化螟不同发育历期稳定性较高的内参基因是AK、RPL10和EF1,不同组织中稳定性较高的内参基因是EF1、TUB和ACTB,不同温度下较稳定的内参基因为TUB、RPL10和EF1,杀虫剂处理样品中较稳定的是TF4和ACTA,取食不同饲料较稳定的是TUB、TF4、EF1和RPL10,取食不同品种水稻较稳定的是TUB和EF1,dsRNA处理样品中较稳定的是TUB、AK、ACTB和EF1,混合样品中较稳定的是EF1、TUB和ACTB。【结论】为不同试验条件下选择合适的内参基因提供了参考,也有利于在二化螟基因表达研究中获得更加可靠准确的数据。

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